| PhyloTree.org - mtDNA subtree R0 | |||||||||||||||
| Citation: van Oven M, Kayser M. 2009. Updated comprehensive phylogenetic tree of global human mitochondrial DNA variation. Hum Mutat 30(2):E386-E394. doi:10.1002/humu.20921 | |||||||||||||||
| Nucleotide positions are relative to the rCRS (GenBank accession NC_012920). Mutations are transitions unless an exact base change is specified. | |||||||||||||||
| Coding region mutations (np 577-16023) are shown in black; control region mutations (np 16024-576) in blue. | |||||||||||||||
| Mutations toward a base identical-by-state to the rCRS are indicated with an exclamation mark (!). | |||||||||||||||
| Mutations between brackets () are recurrent/unstable within the clade, or are yet uncertain based on current data. | |||||||||||||||
| Mutation motifs in italic are preliminary and are likely to be further refined as additional sequences become available. | |||||||||||||||
| The mutations 309.1C(C), 315.1C, 523-524d (aka 522-523d), 16182C, 16183C, 16193.1C(C) and 16519 were not considered for phylogenetic reconstruction and are therefore excluded from the tree. | |||||||||||||||
| Accession numbers provided at the tips of branches are representative examples of mtDNA sequences available at GenBank or from individuals included in HapMap/1000Genomes. | |||||||||||||||
| The references are independent from the accession numbers and refer to publications that have described the corresponding branch and/or have proposed haplogroup nomenclature. | |||||||||||||||
| A list of the references cited is available here. | |||||||||||||||
| It may be convenient to use the Find function (Ctrl+F) of your browser to search for a particular mutation or haplogroup. | |||||||||||||||
| Example accessions | References | ||||||||||||||
| R0 | 73 11719 | Torroni 2006, Behar 2008a, Kivisild 2006, Palanichamy 2004, Achilli 2004, Shen 2004, Brandstätter 2008, Álvarez-Iglesias 2009 | |||||||||||||
| R0a'b | (58) 64 2442 16362 | Achilli 2011 | |||||||||||||
| R0a | 3847 13188 16126 | Torroni 2006, Behar 2008a, Abu-Amero 2007 ("(preHV)1"), Shen 2004, Achilli 2004, Kivisild 2006, Palanichamy 2004, Brandstätter 2008, Álvarez-Iglesias 2009, Černý 2011 | |||||||||||||
| R0a1 | 827 | Abu-Amero 2007 ("(preHV)1a"), Brandstätter 2008, Álvarez-Iglesias 2009, Černý 2011 | |||||||||||||
| R0a1a | 146 8292 11761 16355 | HM185216 | FJ460524 | Abu-Amero 2007 ("(preHV)1a1"), Álvarez-Iglesias 2009, Černý 2011 | |||||||||||
| R0a1a1 | 13708 | HM185217 | HM185263 | Černý 2011 | |||||||||||
| R0a1a1a | 16172 | HM185210 | HM185208 | Černý 2011 | |||||||||||
| R0a1a2 | 93 95C 3972 8020 10652 12741 | HM185258 | HM185260 | Černý 2011 | |||||||||||
| R0a1a3 | 2069 4703 9647 13479T | HM185213 | GU592021 | Černý 2011 | |||||||||||
| R0a1a4 | 3438 5120 5333 | HM185245 | HM185233 | Černý 2011 | |||||||||||
| 152 | HM185256 | Černý 2011 | |||||||||||||
| R0a1b | 26 16093 16189 | DQ904236 | HM185240 | Černý 2011 | |||||||||||
| 60.1T | EU597493 | Černý 2011 | |||||||||||||
| R0a2'3 | 15674 | Černý 2011 | |||||||||||||
| R0a2 | 2355 | HM185266 | AY713999 | Shen 2004, Abu-Amero 2007 ("(preHV)1b"), Behar 2008a ("R0a1"), Brandstätter 2008, Álvarez-Iglesias 2009, Černý 2011 | |||||||||||
| R0a2a | 14544 | HM185257 | EF556170 | Behar 2008a ("R0a1a"), Álvarez-Iglesias 2009, Černý 2011 | |||||||||||
| R0a2b | 5237 15924 16305T | HM185261 | EF556172 | Behar 2008a ("R0a1b"), Álvarez-Iglesias 2009, Černý 2011 | |||||||||||
| R0a2c | 16304 | HM185215 | EF556176 | Behar 2008a ("R0a1c"), Álvarez-Iglesias 2009, Černý 2011 | |||||||||||
| R0a2d | 3438 10728 | HM185241 | JF717359 | Álvarez-Iglesias 2009, Černý 2011 | |||||||||||
| R0a2e | 4106 7256 8701 10493G | DQ904242 | Álvarez-Iglesias 2009, Černý 2011 | ||||||||||||
| R0a2f | 8251 | HM185225 | Černý 2011 | ||||||||||||
| R0a2f1 | 131 7837 12542 13708 13827 | Černý 2011 | |||||||||||||
| R0a2f1a | 11365 | HM185227 | HM185221 | Černý 2011 | |||||||||||
| R0a2f1b | 16207 | HM185228 | HM185248 | Černý 2011 | |||||||||||
| R0a2g | 9128 | HM185271 | HM185218 | Černý 2011 | |||||||||||
| R0a2h | 16172 16184A | HM185238 | DQ904240 | Černý 2011 | |||||||||||
| R0a2i | 9337 11944 16092 (16278) | HM185242 | DQ904241 | Černý 2011 | |||||||||||
| 195 | HM185237 | ||||||||||||||
| R0a2j | 3397 | HM185246 | HM185229 | Černý 2011 | |||||||||||
| R0a2k | 12295 | JF717355 | |||||||||||||
| R0a2k1 | 3531 3644 3918 5557 10398 16114 16325 | HM185254 | HM185253 | Černý 2011 ("R0a2k") | |||||||||||
| R0a2l | 2179 7471d 14392 | HM185250 | HM185244 | Černý 2011 | |||||||||||
| R0a3 | 15466 | HM185265 | HM185223 | Černý 2011 | |||||||||||
| R0b | 93 152 1719 4924 5205 8772 9055 10101 10775 11764 15613 15628 16301 | JF717361 | Achilli 2011 | ||||||||||||
| HV | 14766 | HM776579 | Kivisild 2006, Achilli 2004, Palanichamy 2004, Shen 2004 | ||||||||||||
| HV0 | 72 16298 | Torroni 2006, Behar 2008a, Achilli 2004, Torroni 2001, Palanichamy 2004, Shen 2004 | |||||||||||||
| HV0a | 15904 | AY738945 | Torroni 2006, Achilli 2004, Torroni 2001 | ||||||||||||
| HV0a1 | 10196 16126 | GU122990 | EF649971 | ||||||||||||
| V | 4580 | AY495311 | FJ348173 | Torroni 2006, Achilli 2004, Palanichamy 2004, Torroni 2001 | |||||||||||
| V1 | 4639 8869 | AY738947 | Palanichamy 2004 | ||||||||||||
| V1a | 5263 | FJ348213 | Palanichamy 2004, Finnilä 2001 | ||||||||||||
| V1a1 | 227 485 709 16183 | GU123003 | AY339443 | ||||||||||||
| V1a2 | 12490 | EF661005 | EF177419 | ||||||||||||
| V2 | 13105 | EF660946 | EF657320 | Palanichamy 2004 | |||||||||||
| V2a | 12438 | AY713979 | Palanichamy 2004 | ||||||||||||
| V2a1 | 9088 14793 | AY495322 | Álvarez-Iglesias 2009 | ||||||||||||
| V2a1a | 5250 | AY495317 | AY495323 | Álvarez-Iglesias 2009 | |||||||||||
| V2b | 14770 | AY495313 | Álvarez-Iglesias 2009 | ||||||||||||
| V2b1 | 15773 | AY495319 | AY495310 | Álvarez-Iglesias 2009 | |||||||||||
| V3 | 12810 | AY495330 | EU567326 | Álvarez-Iglesias 2009 | |||||||||||
| V4 | 15250 | AY495312 | FJ384440 | ||||||||||||
| V5 | 14550 16203 | AY339451 | AY339452 | ||||||||||||
| V6 | 16162 | FJ348207 | EF506486 | ||||||||||||
| V7 | 7444 | AF347006 | DQ112936 | ||||||||||||
| V7a | 93 11899 16153 | AY339446 | EU567454 | ||||||||||||
| V8 | 13350 14016 | AY339457 | AY339456 | ||||||||||||
| V9 | 204 207 | EF177445 | |||||||||||||
| V9a | 8179 11581 13759 16298! | JN006823 | |||||||||||||
| V9a1 | 16192 16219 | FJ865560 | DQ658411 | ||||||||||||
| V10 | 9368 (16261) | GQ304748 | HQ729918 | ||||||||||||
| 195 | AY738944 | AF346978 | |||||||||||||
| HV0b | 198 | EF556192 | EF660977 | Behar 2008a, Álvarez-Iglesias 2009 | |||||||||||
| HV0c | 6413 | EU597539 | EF471977 | Álvarez-Iglesias 2009 | |||||||||||
| HV1 | 8014T 16067 | JF320654 | Musilová 2011 | ||||||||||||
| HV1a'b'c | 15218 | AY738943 | EF660936 | Achilli 2004 ("HV1"), Behar 2008a ("HV1"), Shen 2004 ("HV1"), Álvarez-Iglesias 2009 ("HV1"), Musilová 2011 ("HV1") | |||||||||||
| HV1a | 8277 | Álvarez-Iglesias 2009, Musilová 2011 | |||||||||||||
| HV1a1 | 150 15927 16355 | HM852761 | Behar 2008a ("HV1a"), Álvarez-Iglesias 2009, Musilová 2011 | ||||||||||||
| HV1a1a | 4227 9554 | HM575427 | JF260938 | Behar 2008a, Musilová 2011 | |||||||||||
| HV1a1b | 6150 7379 | FJ210914 | Musilová 2011 | ||||||||||||
| HV1a2 | 4596 | JF260943 | JF316743 | Musilová 2011 | |||||||||||
| HV1a2a | 14587 | JF260942 | EU935461 | Musilová 2011 | |||||||||||
| HV1a3 | 3421 16327A | JF260935 | JF260937 | Musilová 2011 | |||||||||||
| HV1b | 12696 | AY738942 | Álvarez-Iglesias 2009, Musilová 2011 | ||||||||||||
| HV1b1 | 2626 4739 7598 16274 | EF556182 | Behar 2008a, Álvarez-Iglesias 2009, Musilová 2011 | ||||||||||||
| HV1b1a | 11314 14861 | JF260951 | JF260949 | Musilová 2011 | |||||||||||
| HV1b1b | 5656 | JF260948 | JF260947 | Musilová 2011 | |||||||||||
| 152 | JF260944 | HM998901 | Musilová 2011 | ||||||||||||
| HV1b2 | 3547 6023 16189 | DQ856316 | EF396958 | Musilová 2011 | |||||||||||
| HV1c | 182 13933 15930 16172 | EF556190 | Behar 2008a, Álvarez-Iglesias 2009, Musilová 2011 | ||||||||||||
| HV1d | 146 249d 2308 7372 11476 12279 13143 13650 13708 16278 16362 | JF260933 | JF260932 | Musilová 2011 | |||||||||||
| 73 | EU935433 | HQ436102 | |||||||||||||
| HV2 | 195 7193 9336 11935 12061 16217 | AY713986 | Shen 2004 ("HV3"), Palanichamy 2004, Álvarez-Iglesias 2009 | ||||||||||||
| HV2a | 246 573.1CCC 5147 15164 16214 16335 | EU567452 | EU567456 | ||||||||||||
| HV4 | 7094 | EF417833 | EU545447 | Malyarchuk 2008a, Álvarez-Iglesias 2009, García 2011 | |||||||||||
| HV4a | 16221 | García 2011 | |||||||||||||
| HV4a1 | 13680 | HM765460 | EF660939 | García 2011 | |||||||||||
| HV4a1a | 16291 | GQ888728 | HQ675034 | Seoane 2011 | |||||||||||
| HV4a2 | 7805 16129 | EU935457 | García 2011 | ||||||||||||
| HV4a2a | 16221! 16287 16311 | GQ888731 | HM228422 | ||||||||||||
| HV4b | 1715 16069 | EF222234 | HM852851 | ||||||||||||
| HV4c | 2758 3834 10356 | JQ272477 | AY738941 | ||||||||||||
| HV5 | 12133 13105 | DQ377992 | EU558385 | FamilyTreeDNA, Álvarez-Iglesias 2009 | |||||||||||
| 16311 | EF660945 | EU545435 | Palanichamy 2004, Malyarchuk 2008a ("HV3") | ||||||||||||
| HV6 | 6755 16172 | HQ658738 | EF222232 | Malyarchuk 2008a ("HV3b"), Álvarez-Iglesias 2009 | |||||||||||
| HV6a | 3507 8545 9266 16113C | EU545454 | EU545439 | Malyarchuk 2008a ("HV3b1"), Álvarez-Iglesias 2009 | |||||||||||
| HV7 | 5471 14560 | EU545443 | EU545441 | Malyarchuk 2008a ("HV3c"), Álvarez-Iglesias 2009 | |||||||||||
| HV8 | 16354 | EU545457 | EF222246 | Malyarchuk 2008a ("HV3d"), Álvarez-Iglesias 2009 | |||||||||||
| HV9 | 8994 | EF222233 | Malyarchuk 2008a ("HV3a"), Álvarez-Iglesias 2009 | ||||||||||||
| 152 | EF222253 | ||||||||||||||
| HV9a | 131 | EU545422 | EF222247 | ||||||||||||
| HV10 | 13449 | EF222245 | HM008695 | ||||||||||||
| HV11 | 6040 9000 10283 | GU592045 | EF660954 | ||||||||||||
| HV14 | 480 4655 15115 | NA18743 | AY713988 | ||||||||||||
| HV12 | 13889 | ||||||||||||||
| HV12a | 16220C 16292 | HQ844516 | HM852849 | ||||||||||||
| HV12b | 150 15682 | AY713976 | AY713987 | ||||||||||||
| HV13 | 16357 | JF700125 | HM852828 | Shen 2004 | |||||||||||
| H | 2706 7028 | Roostalu 2007, Achilli 2004, Loogväli 2004, Palanichamy 2004 | |||||||||||||
| H1 | 3010 | Behar 2008a, Roostalu 2007, Achilli 2004, Shen 2004 | |||||||||||||
| H1a | 73 16162 | EU130942 | EU200235 | Loogväli 2004, Roostalu 2007 | |||||||||||
| H1a1 | 6365 16209 | AY495188 | AY495189 | Roostalu 2007 | |||||||||||
| H1a2 | 8271T | EU130562 | AY339424 | Roostalu 2007 | |||||||||||
| H1a3 | 16051 | AY738972 | FJ348176 | ||||||||||||
| 16189 | Roostalu 2007 | ||||||||||||||
| H1b | 3796 16356 16362 | AY738975 | EU600348 | Loogväli 2004, Roostalu 2007 | |||||||||||
| H1f | 4452 7309 9066 16093 | AY339413 | AY339420 | Loogväli 2004, Roostalu 2007 | |||||||||||
| H1g | 8602 14212 | EF657466 | EF657782 | Brandstätter 2008 ("H1-8602"), Álvarez-Iglesias 2009 | |||||||||||
| H1k | 5206 15766 16290 | EU770202 | EU768844 | ||||||||||||
| H1q | 4859 | EF660973 | EF657590 | ||||||||||||
| H1c | 477 | AY495102 | EU597509 | Roostalu 2007 | |||||||||||
| H1c1 | 9150 16263 | AY495157 | AY495160 | Roostalu 2007 | |||||||||||
| H1c2 | 8764 12858 | AY495096 | AY495113 | Roostalu 2007 | |||||||||||
| H1c3 | 257 8473 | HM625701 | GU289555 | ||||||||||||
| H1e | 5460 | EU555475 | EU148452 | Behar 2008a | |||||||||||
| H1e1 | 8512 | EF660949 | |||||||||||||
| H1e1a | 14902 | EU597560 | EF177428 | ||||||||||||
| H1e2 | 15817 | AY495094 | AY738971 | ||||||||||||
| H1h | (146) 11914 | AY339412 | GQ334714 | ||||||||||||
| H1i | 6237A | EU568371 | EF657459 | ||||||||||||
| H1j | 4733 | EU372630 | EF177436 | Pereira 2004, Gómez-Carballa 2011 | |||||||||||
| 16129 | HQ384178 | Gómez-Carballa 2011 | |||||||||||||
| H1j1 | 3849 | HQ384173 | HQ384175 | Gómez-Carballa 2011 | |||||||||||
| H1m | 15323 | AY495152 | AY495106 | ||||||||||||
| H1n | 146 2098 | FJ348199 | EU089747 | ||||||||||||
| H1o | 267 485 6446T 11002 14053 15844 | EF556177 | Behar 2008a | ||||||||||||
| H1p | 13470 | EF556184 | Behar 2008a | ||||||||||||
| H1r | 9356 | GQ888727 | AF346981 | García 2011 | |||||||||||
| H1s | 8572 | GQ478575 | EU080974 | ||||||||||||
| H1t | 9986 | García 2011 | |||||||||||||
| H1t1 | 14129 14224 | GQ888723 | GQ888724 | García 2011 | |||||||||||
| H1t2 | 5978 | GQ888725 | EF177427 | García 2011 | |||||||||||
| H1u | 9923 | AY495103 | DQ112861 | ||||||||||||
| H1v | 10314 | FJ460532 | Ottoni 2010 | ||||||||||||
| H1v1 | 4313 | Ottoni 2010 | |||||||||||||
| H1v1a | 9148 | HM171271 | Ottoni 2010 | ||||||||||||
| H1v1b | 14560 | HM171273 | Ottoni 2010 | ||||||||||||
| H1w | 8966 | HM171275 | HM171277 | Ottoni 2010 | |||||||||||
| H1x | 7765 10410A 16037 16256 | HM171279 | HM171278 | Ottoni 2010 | |||||||||||
| H2 | 1438 | Roostalu 2007 | |||||||||||||
| H2a | 4769 | EU597492 | Loogväli 2004 ("H2"), Carelli 2006 ("H2"), Roostalu 2007 | ||||||||||||
| H2a1 | 951 16354 | EU597521 | FJ161702 | Loogväli 2004, Roostalu 2007 | |||||||||||
| H2a1a | 6173 | FJ668389 | AY339428 | ||||||||||||
| H2a2 | 750 | Loogväli 2004 ("H2b"), Carelli 2006 ("H2b"), Roostalu 2007 | |||||||||||||
| H2a2a | 263 8860 15326 | NC_012920 | Behar 2008b | ||||||||||||
| H2a2b | 16291 | AY339426 | |||||||||||||
| H2a2b1 | 16235 | EU443605 | EF418606 | ||||||||||||
| H2a3 | 10810 16274 | AY339429 | AY738962 | Roostalu 2007, Achilli 2004 ("H2c") | |||||||||||
| H2a4 | 11140 | AM263179 | AM263181 | Roostalu 2007 | |||||||||||
| H2a5 | 13708 | Catelli 2011 | |||||||||||||
| H2a5a | 1842 16291 | Catelli 2011 | |||||||||||||
| H2a5a1 | 4592 | FJ527772 | FJ527777 | Álvarez-Iglesias 2009 ("H2a5"), Catelli 2011 | |||||||||||
| H2a5a2 | 11233 | JF284817 | AY738963 | Catelli 2011 | |||||||||||
| H2a5b | 8843 (16183) | HQ153430 | DQ112834 | ||||||||||||
| H2b | 152 8598 16311 | AY738961 | EU597574 | Roostalu 2007 | |||||||||||
| H3 | 6776 | Loogväli 2004, Roostalu 2007 | |||||||||||||
| H3a | (152) 13404 (16239G) | AY738986 | EF657646 | Roostalu 2007 | |||||||||||
| H3b | 2581 | AY738988 | FJ348205 | Roostalu 2007 | |||||||||||
| H3c | 12957 | AY738991 | AY738990 | Roostalu 2007 | |||||||||||
| H3d | 73 | AY495180 | AY495177 | Álvarez-Iglesias 2009 | |||||||||||
| H3e | 1618 15592 | FJ348204 | FJ348206 | ||||||||||||
| H3f | 93 | DQ523639 | EU150187 | ||||||||||||
| H3g | (152) 10754C | AY495142 | AY495125 | ||||||||||||
| H3h | 12811 16311 | HM636799 | FJ349555 | Achilli 2011 | |||||||||||
| H4 | 3992 5004 9123 | EU935460 | Roostalu 2007 | ||||||||||||
| H4a | 4024 14365 14582 | AY495123 | EF177440 | Loogväli 2004 ("H4"), Roostalu 2007 | |||||||||||
| H4a1 | 8269 | EU664586 | Loogväli 2004 ("H4a"), Roostalu 2007 | ||||||||||||
| H4a1a | 10044 | AY495095 | AY495111 | Roostalu 2007 | |||||||||||
| H4a1a1 | 73 | AY495184 | EU719211 | Álvarez-Iglesias 2009 | |||||||||||
| H4a1a1a | 10007 10034 | AY495186 | EF660991 | ||||||||||||
| H4a1b | 195 513 5773 13889 14133 | EF556191 | Behar 2008a ("H4a1a"), Alvarez-Iglesias 2009 | ||||||||||||
| H4a2 | 7581 15497 15930 | AY738950 | EF657591 | Kong 2006 | |||||||||||
| H4b | 10166 | AM263185 | Roostalu 2007 | ||||||||||||
| H5'36 | 456 | ||||||||||||||
| H5 | 16304 | AY495172 | FJ384434 | Loogväli 2004, Roostalu 2007 | |||||||||||
| H5a | 4336 | AY495175 | Loogväli 2004, Roostalu 2007 | ||||||||||||
| H5a1 | 15833 | AY339432 | AY495165 | Loogväli 2004, Roostalu 2007 | |||||||||||
| H5a2 | (200) 5839 (16093) | AY738952 | DQ112946 | ||||||||||||
| H5b | 5471 | EU597579 | EU915472 | ||||||||||||
| H36 | 152 3525A 16070 | AY339405 | |||||||||||||
| H36a | 8578 13056 | FJ348166 | FJ348151 | ||||||||||||
| 16362 | Roostalu 2007 | ||||||||||||||
| H6 | 239 16482 | FJ652065 | Loogväli 2004, Roostalu 2007 | ||||||||||||
| H6a | 3915 | Loogväli 2004, Roostalu 2007 | |||||||||||||
| H6a1 | 4727 9380 | Loogväli 2004, Roostalu 2007 | |||||||||||||
| H6a1a | 11253 | GU004258 | FJ713600 | Behar 2008a | |||||||||||
| H6a1a1 | 5460 | AM263177 | |||||||||||||
| H6a1a1a | 7325 9362 11611 (16311) | EF556185 | EF657756 | Behar 2008a | |||||||||||
| H6a1b | 10589 | EU600329 | Behar 2008a | ||||||||||||
| H6a1b1 | 6218 7859 8563 15930 16284 | EF556178 | Behar 2008a, Álvarez-Iglesias 2009 | ||||||||||||
| H6a1b2 | 9254 | EU154342 | EU919746 | ||||||||||||
| H6b | 14040 16300 | AY738956 | FJ348203 | Loogväli 2004, Roostalu 2007 | |||||||||||
| H8 | 146 195 709 13101C 16288 | AY195758 | EU600360 | Loogväli 2004, Roostalu 2007 | |||||||||||
| H7 | 4793 | AY495108 | EF408656 | Loogväli 2004, Roostalu 2007 | |||||||||||
| H7a | 1719 | AY495105 | AY738964 | Köhnemann 2008 | |||||||||||
| H7a1 | 16261 | DQ862537 | EF177430 | ||||||||||||
| H7b | 5348 | EF581833 | AY495104 | ||||||||||||
| H7b1 | 12351 | EU600357 | AY738966 | ||||||||||||
| H7c | 6296A | GQ422375 | |||||||||||||
| H7c1 | 16265 | AY738965 | EU600356 | ||||||||||||
| H9 | 152 13020 | AY713978 | |||||||||||||
| H9a | 3591 4310 (16168) | AY738969 | EF657517 | Roostalu 2007 ("H9") | |||||||||||
| H10 | 14470A | AY495093 | EU156036 | Loogväli 2004, Roostalu 2007 | |||||||||||
| H10a | 4216 | AY495101 | EF491002 | ||||||||||||
| H10a1 | 14548 16114 | EU073971 | AY738970 | ||||||||||||
| 195 | |||||||||||||||
| H11 | 8448 13759 16311 | Loogväli 2004 ("H11a"), Roostalu 2007 | |||||||||||||
| H11a | 961G | Loogväli 2004, Roostalu 2007 | |||||||||||||
| H11a1 | 8898 (16278) | AY738958 | EF657502 | Loogväli 2004, Brandstätter 2008 ("H11a"), Álvarez-Iglesias 2009 ("H11a") | |||||||||||
| H11a2 | 14587 16092 16140 (16293) | EF545566 | FJ705060 | ||||||||||||
| H12 | 3936 14552 | AY738993 | AY738994 | Roostalu 2007, Carelli 2006 | |||||||||||
| H13 | 14872 | EF660920 | Behar 2008a, Roostalu 2007 | ||||||||||||
| H13a | 2259 | Roostalu 2007 | |||||||||||||
| H13a1 | 4745 | AM263187 | EU597515 | Roostalu 2007 | |||||||||||
| H13a1a | 13680 | AY738996 | FJ560455 | Achilli 2004 | |||||||||||
| H13a1a1 | 7337 | EF660918 | |||||||||||||
| H13a1a1a | 13326 | AY738995 | AY339410 | Achilli 2004 ("H13a") | |||||||||||
| H13a1a2 | 13542 | AY738997 | EU600347 | ||||||||||||
| H13a2 | 709 | AM263190 | AY339409 | Roostalu 2007 | |||||||||||
| H13a2a | 1008 | AY713980 | Behar 2008a | ||||||||||||
| H13a2a1 | 183 524.1AC 7184 11151 | EF556150 | Behar 2008a, Álvarez-Iglesias 2009 | ||||||||||||
| H13a2b | 13762G | HQ658464 | HQ593813 | ||||||||||||
| H13a2b1 | 4639 15001 16311 | EF556156 | EF660948 | ||||||||||||
| H13b | 4107 | AM263188 | EU052289 | ||||||||||||
| H14 | 7645 10217 | AM263182 | Thangaraj 2008, Roostalu 2007, Behar 2008a | ||||||||||||
| H14a | 16256 16352 | AM263183 | Roostalu 2007 | ||||||||||||
| H14a1 | 146 7864 11002 12870 | EF556163 | Behar 2008a, Álvarez-Iglesias 2009 | ||||||||||||
| H15 | 55 57 6253 | Roostalu 2007 | |||||||||||||
| H15a | 11410 | AY495146 | |||||||||||||
| H15a1 | (57G) 14953 | AY713995 | FJ348171 | ||||||||||||
| H15b | 3847 | AY738960 | EU600353 | ||||||||||||
| H16 | 10394 | Roostalu 2007 | |||||||||||||
| 152 | AY495135 | AY495127 | |||||||||||||
| H16a | 8592 | EU170619 | AY495133 | Álvarez-Iglesias 2009 | |||||||||||
| H16b | 9129 | AY495110 | EU715287 | ||||||||||||
| 16129 | |||||||||||||||
| H17 | 3915 | AY495150 | |||||||||||||
| H17a | 6296 | AY495154 | EF657507 | Roostalu 2007 ("H17") | |||||||||||
| H27 | 11719 16093 16316 | EU007878 | FJ348192 | ||||||||||||
| H18 | 13708 14364 | AY495116 | EF657723 | Roostalu 2007 | |||||||||||
| H19 | 6272 14869 | EF657418 | EF657730 | Roostalu 2007 | |||||||||||
| H20 | 16218 | EU600339 | EU600331 | Roostalu 2007 | |||||||||||
| H20a | 249d 292 16328A 16362 | EF556187 | Behar 2008a | ||||||||||||
| 16192 | |||||||||||||||
| H21 | 186 3822 8994 | AM263178 | Roostalu 2007 | ||||||||||||
| H30 | 195 504 8200 8638 8817 14241 | EF556162 | Behar 2008a | ||||||||||||
| H22 | 16145 16227 | Álvarez-Iglesias 2009, Achilli 2007 ("H19") | |||||||||||||
| H23 | 10211 | AY495091 | EF657462 | Álvarez-Iglesias 2009 | |||||||||||
| H24 | 3333 (16293) | EF363133 | EF657250 | ||||||||||||
| H25 | 9620 | EF556189 | EF657408 | Behar 2008a | |||||||||||
| H26 | 11152 | EU684000 | EU600338 | ||||||||||||
| H28 | 186A 8715 11191 | EU670874 | EU543281 | ||||||||||||
| H29 | 93 573.1CC 5582 | EU600335 | EF660925 | ||||||||||||
| H31 | 146 195 7930T 10771 | EF660914 | JQ028728 | ||||||||||||
| H32 | 73 152 8557 | DQ523619 | EF660931 | ||||||||||||
| H33 | 11447 | EF458167 | EU600341 | ||||||||||||
| H34 | 15519 16291 | EU007846 | AY738968 | ||||||||||||
| H35 | 3342 | EU007865 | EF660969 | ||||||||||||
| H37 | 3531 | EU597523 | AY738948 | ||||||||||||
| H38 | 235 | FJ348221 | EU677386 | ||||||||||||
| H39 | 16299 | EU677425 | AY339402 | ||||||||||||