PhyloTree.org - mtDNA subtree R
Citation: van Oven M, Kayser M. 2009. Updated comprehensive phylogenetic tree of global human mitochondrial DNA variation. Hum Mutat 30(2):E386-E394. doi:10.1002/humu.20921
Nucleotide positions are relative to the rCRS (GenBank accession NC_012920). Mutations are transitions unless an exact base change is specified.
Coding region mutations (np 577-16023) are shown in black; control region mutations (np 16024-576) in blue.
Mutations toward a base identical-by-state to the rCRS are indicated with an exclamation mark (!).
Mutations between brackets () are recurrent/unstable within the clade, or are yet uncertain based on current data.
Mutation motifs in italic are preliminary and are likely to be further refined as additional sequences become available.
The mutations 309.1C(C), 315.1C, 523-524d (aka 522-523d), 16182C, 16183C, 16193.1C(C) and 16519 were not considered for phylogenetic reconstruction and are therefore excluded from the tree.
Accession numbers provided at the tips of branches are representative examples of mtDNA sequences available at GenBank.
The references are independent from the accession numbers and refer to publications that have described the corresponding branch and/or have proposed haplogroup nomenclature.
A list of the references cited is available here.
It may be convenient to use the Find function (Ctrl+F) of your browser to search for a particular mutation or haplogroup.
                                  Accession numbers References
R  12705  16223                                
                                   
  R0  73  11719                             Torroni 2006, Behar 2008a, Kivisild 2006, Palanichamy 2004, Achilli 2004, Shen 2004, Brandstätter 2008, Álvarez-Iglesias 2009
                                 
  R1  295A  1391  3360  4917  5586  5823  6557  6671  7547  8388  8887  10658  10825  13948  14632  15721  16311           EF177423 Malyarchuk 2008a
                               
    R1a  4026  5378  7424                         AY714045 Malyarchuk 2008a, Palanichamy 2004
                               
      R1a1  13105  13368                         Malyarchuk 2008a
                               
        R1a1a  6261                       EF222243, EF222244 Malyarchuk 2008a
                               
  R2'JT  4216                               Palanichamy 2004
                                 
    R2  152  7657  8473  9932  10685  12654  13500  14305  16071                 AY714007 Palanichamy 2004, Metspalu 2006
                               
    JT  11251  15452A  16126                         Palanichamy 2004, Derenko 2007, Logan 2009
                                 
      J  295  489  10398  12612  13708  16069                     Palanichamy 2004, Derenko 2007, Logan 2009, Carelli 2006
                                 
        J1  462  3010                       Palanichamy 2004, Carelli 2006, Derenko 2007, Logan 2009
                                 
          J1b  8269  16145  16222  16261                 DQ282491 Logan 2009, Abu-Amero 2008, Behar 2008a ("J1b'e"), Malyarchuk 2008c ("J1a'b")
                               
            J1b1  5460  13879                   Logan 2009, Abu-Amero 2008, Malyarchuk 2008c ("J1b"), Behar 2008a, Carelli 2006 ("J1b"), Palanichamy 2004 ("J1b"), Derenko 2007 ("J1b")
                                 
              J1b1a  242  2158  8557  12007  16172             EU915478, AY495238 Logan 2009, Abu-Amero 2008 ("J1b1a1"), Palanichamy 2004 ("J1b1"), Malyarchuk 2008c, Derenko 2007 ("J1b1")
                               
                J1b1a1  15067               AY495232, AY339581 Logan 2009, Abu-Amero 2008 ("J1b1a1b")
                               
                J1b1a2  5463  6911  16192             FJ213450 Logan 2009, Abu-Amero 2008 ("J1b1a1a")
                               
              J1b1b  271                 AY714033 Logan 2009, Derenko 2007 ("J1b2"), Malyarchuk 2008c
                               
                J1b1b1  10410A  16222!             EF556155, EF397558 Logan 2009, Derenko 2007 ("J1b2a")
                               
            J1b2  1733                   EF556169, DQ282488 Logan 2009, Abu-Amero 2008, Behar 2008a
                               
            J1b3  8460  16235  16271                 EF583175, EF583177 Logan 2009, Malyarchuk 2008c ("J1a")
                               
          J1c  (185)  (228)  14798                   AY495205, GU123016 Palanichamy 2004, Carelli 2006, Malyarchuk 2008c, Logan 2009
                               
            J1c1  482  3394                 AY495208, AY195754 Palanichamy 2004, Logan 2009 ("J1c2")
                               
              J1c1a  185!  9635C  11623  13899             AY495210, FJ447985 Logan 2009 ("J1c2a")
                               
              J1c1b  7184                 AY495202, DQ112800 Palanichamy 2004, Logan 2009 ("J1c2b")
                               
                J1c1b1  5773               EF177420, EF452293 Logan 2009 ("J1c2b1")
                               
                  J1c1b1a  10463             AY714034, FJ502349 Logan 2009 ("J1c2b1a")
                               
            J1c2  188                   AY495223, FJ499472 Logan 2009 ("J1c1")
                               
              J1c2b  4454                 AY495222, AY339588 Logan 2009 ("J1c1b")
                               
              J1c2c  10685  13281  13933               FJ348202, EF177422 Logan 2009 ("J1c1c")
                               
                J1c2c1  222               FJ449571 Logan 2009 ("J1c1c1")
                               
            J1c3  13934                   AY495214, FJ603099 Logan 2009
                               
              J1c3a  9548                 AY495213 Logan 2009
                               
                J1c3a1  7711               EF657560, AY495211 Logan 2009
                               
              J1c3b  15367                 EF657671 Logan 2009
                               
                J1c3b1  5237  6261             FJ445407 Logan 2009
                               
              J1c3c  2706!                 EF657260, EF657374  
                                 
            J1c4  9632  12083G                 AF346983, FJ538285 Logan 2009
                               
              J1c4b  9120                 GU808335, AY665667 Logan 2009
                               
            J1c5  5198                   EF657710, AY495199 Logan 2009
                               
              J1c5a  2387  10192               DQ112793, EF657290 Logan 2009
                               
            J1c6  4025                   AY495196, EU073970 Logan 2009
                               
               16261                   FJ348153  
                                 
              J1c7  6554  12127  (16092)             EU151466 Logan 2009
                               
                J1c7a  6464A  13681             FJ348162, HM171294 Logan 2009
                               
            J1c8  10084  10398!  16319               GU906781, EF657735  
                                 
          J1d  152  7789  7963  (16193)                 DQ341088, EU597552 Carelli 2006, Logan 2009
                               
            J1d1  16300                   AF382001, EF184636 Logan 2009
                               
        J2  (150)  (152)  7476  15257                     Logan 2009, Palanichamy 2004, Carelli 2006, Behar 2008a
                                 
          J2a  195  10499  11377                     Logan 2009
                                 
            J2a1  (215)  (319)  (513)  7789  14133  16145  16231           DQ341089  
                               
              J2a1a  13722  16261               EU931680, FJ605154 Logan 2009 ("J2a1")
                               
                J2a1a1  310.1T  1850             GU903270  
                               
                  J2a1a1a  (189)  10237  (16172)         AY339579, AY339580  
                                 
                  J2a1a1b  3447             FJ348157, EU721734  
                                 
            J2a2  152!  6671  11002  12570  15679             FJ460543, FJ460559 Logan 2009
                               
              J2a2a  235  8386               EF660967, EF657532 Logan 2009 ("J2a2a1")
                               
          J2b  5633  15812  16193                   FJ213765 Palanichamy 2004, Carelli 2006, Behar 2008a
                               
            J2b1  10172                   EU862198, EU807741 Palanichamy 2004 ("J2b"), Carelli 2006 ("J2b"), Logan 2009 ("J2b")
                               
              J2b1a  16278                 EU597520, EU673448 Logan 2009 ("J2b1")
                               
                J2b1a1  14569               FJ380056, EF657691 Logan 2009 ("J2b1a")
                               
                J2b1a2  6216               AY339577, GQ249257 Logan 2009 ("J2b1b")
                               
                J2b1a3  10966               AY195778  
                                 
              J2b1b  2404  6962T  10389               EU862198 Logan 2009 ("J2b2")
                               
      T  709  1888  4917  8697  10463  13368  14905  15607  15928  16294               Palanichamy 2004, Kivisild 2006
                                 
        T1  12633A  16163  16189                   EU369395 Palanichamy 2004, Kivisild 2006
                               
          T1a  16186                     EU935435, EF177409  
                                 
               152                   EU935439, EU979542  
                                   
                 195                    
                                 
                T1a1  9899               AY495294, EU597578 Palanichamy 2004 ("T1a"), Kivisild 2006
                               
                  T1a1b  10143             AY339575  
                               
                    T1a1b1  14281           HM184912, AY714036 Palanichamy 2004
                               
                T1a2  384  4959  5558  9300  16261           FJ348220, EF177441  
                                 
                T1a3  7258  10321             AY495296, EF645646  
                                 
          T1b  16243                     AY339570, FJ878777 Palanichamy 2004
                               
        T2  11812  14233  (16296)                   EF177442 Palanichamy 2004, Kivisild 2006
                               
          T2a  13965                     FJ238094 Palanichamy 2004
                               
            T2a1  14687                   GU123001, EF657558  
                               
              T2a1a  2850  7022               AY495300, AY714022  
                                 
                T2a1a1  (143)  8715             FJ348180, EF657455  
                                 
                T2a1a2  4688               GU553285, EF657732  
                                 
              T2a1b  2141  9117  13966               EF657600, EF657401  
                                 
          T2b  930  5147  16304                   AY495273, EU744542 Palanichamy 2004, Richards 2000 ("T2")
                               
            T2b1  14016                   EF177444, AY495267  
                               
            T2b2  11242G                   AY495305, AY714016  
                               
            T2b3  10750                   AY495275  
                               
              T2b3a  151  152  5656  16292             DQ523649, EF660963  
                               
               16296!                   EU926622  
                                   
              T2b4  9254                 GU123018, EU494628  
                               
            T2b5  3826                   AY495286, GQ304744  
                                 
            T2b6  458  1709  9300  11533               AY495284, AY495282  
                                 
            T2b7  9966                   GU170817, EF660992 Rani 2010
                               
            T2b8  3338                   GU122998  
                                 
          T2c  10822  16292                   AY339566 Behar 2008a, Richards 2000 ("T3")
                               
            T2c1  152  6261                 DQ112814  
                               
              T2c1a  8455  13973T               EF556160, EF660941 Behar 2008a ("T2c1")
                               
              T2c1b  (146)  (279)  5187  7873             DQ523629, EF657599  
                                 
          T2d  152  5747  13260  13708                 AY714037, DQ437577  
                               
          T2e  150  16153                   EF177410, EU597536 Richards 2000 ("T5")
                               
               16296!                   EU700086, AF381985  
                                   
              T2e1  41                 EF556188, EU258890  
                               
            T2e2  9139                   EF060363, AY714029  
                                 
          T2f  (195)  (8270)  8281-8289d  (16189)  (16298)             EF657281, DQ112763  
                                 
            T2f1  5277  5426  6489A  15043               GU932663, GU123028 Howell and Herrnstadt Howell (personal communication), Bandelt 2008
                               
          T2g  200  1977  3834  14798  14839                 EU007862, EF556186 Behar 2008a
                               
  R5  8594  10754  14544  16304  16524                       AY713998 Chaubey 2008a, Palanichamy 2004, Metspalu 2006, Thangaraj 2008
                               
    R5a  16266                             Chaubey 2008a, Palanichamy 2004, Behar 2008a
                                 
      R5a1  93  200  2833                       FJ004837 Chaubey 2008a, Behar 2008a
                               
        R5a1a  8987  9708  10084                     FJ004822, AY713983 Chaubey 2008a, Behar 2008a
                               
      R5a2  152  11293  13635  14040  15385  16356                   AY713993 Chaubey 2008a, Palanichamy 2004
                               
        R5a2a  16266!  16311                     AY713985, AY713996 Chaubey 2008a
                               
        R5a2b  597.1T  14990  16309  16325                   FJ004815, FJ004814 Chaubey 2008a, Palanichamy 2004
                               
          R5a2b1  6629                     AY713991, AY714000 Chaubey 2008a
                               
          R5a2b2  16266!                     AY714002, FJ004829 Chaubey 2008a
                               
          R5a2b3  11409                     FJ004833, FJ004812 Chaubey 2008a
                               
          R5a2b4  13827                     FJ004834, FJ004828 Chaubey 2008a
                               
  R6  195  12285  16274  16362                         AY713994 Chaubey 2008a, Palanichamy 2004, Metspalu 2006, Thangaraj 2008
                               
    R6a  16129  16266                         AY714028 Chaubey 2008a
                               
      R6a1  228  8584  11075  14058                     AY714019 Chaubey 2008a
                               
        R6a1a  195!  373  961  6305  7316  8650  16274!  16318  16320             FJ004819, FJ004816 Chaubey 2008a
                               
  R7  1442  6248  7870  9051  9110  10289  13105  13830  16260  16261  16319  16362                 Chaubey 2008a, Palanichamy 2004, Thangaraj 2008
                                 
    R7a  10143  10915  13404  15346                       AY714030 Chaubey 2008a
                               
      R7a1  12406  13674                       FJ004835, FJ004805 Chaubey 2008a
                               
        R7a1a  5585  15497  16146                     FJ004823, EU597487 Chaubey 2008a
                               
        R7a1b  3105                         Chaubey 2008a
                                 
          R7a1b1  4596  16075                   FJ004831, FJ004813 Chaubey 2008a
                               
          R7a1b2  16390                     FJ004804, FJ004810 Chaubey 2008a
                               
    R7b  146  2282  8557  14064  16311                         Rani 2010
                                 
      R7b1  1804  12432  15942                       FJ004817 Chaubey 2008a ("R7b")
                               
        R7b1a  152  6254  15326!                     AY714024 Chaubey 2008a ("R7b1")
                               
          R7b1a1  9325  11776                   FJ004811, FJ004821 Chaubey 2008a ("R7b1a")
                               
      R7b2  3817  7310  7711  11380  12246  12384  12940                 GU170816, GU170819 Rani 2010 ("R7b1b")
                               
  R8  195  2755  3384  7759  9449  13215                       AY714009 Thangaraj 2009, Chaubey 2008a, Palanichamy 2004
                               
    R8a  5510  15326!                           Thangaraj 2009, Chaubey 2008a, Palanichamy 2005
                                 
      R8a1  709  5911  13782                         Thangaraj 2009
                                 
        R8a1a  9716                       FJ467953 Thangaraj 2009, Chaubey 2008a ("R8a1")
                               
          R8a1a1  8646                     FJ467965, FJ004808 Thangaraj 2009, Chaubey 2008a ("R8a1a")
                               
            R8a1a1a  6131                   FJ467978, FJ467943 Thangaraj 2009
                               
            R8a1a1b  16153                   FJ467949, FJ467951 Thangaraj 2009
                               
            R8a1a1c  11914                   FJ467942, FJ467955 Thangaraj 2009
                               
            R8a1a1d  9210  12462A  16390               HM345949, FJ467947  
                                 
          R8a1a2  4205  16324                   FJ467952 Thangaraj 2009
                               
            R8a1a2a  7364  8598  11172  11497  12127             FJ467971, FJ467974 Thangaraj 2009, Chaubey 2008a ("R8a1b2")
                               
          R8a1a3  16292                     AY714011, FJ467984 Thangaraj 2009, Chaubey 2008a ("R8a1b1")
                               
           16093                       FJ467972 Thangaraj 2009 ("R8a1b")
                                 
          R8a1b  13212  14041                   FJ467968, FJ467970 Thangaraj 2009
                               
      R8a2  185  189  195!  11864                     FJ467985, FJ004836 Thangaraj 2009
                               
    R8b  456  6485  12007  13194  16390                         Thangaraj 2009
                                 
      R8b1  154                         FJ467941, FJ467948 Thangaraj 2009
                               
        R8b1a  2392                       FJ467940, AY714009 Thangaraj 2009
                               
      R8b2  150  456.1T  4136  14502  15250  16172                   FJ467989, FJ467987 Thangaraj 2009
                               
     16304                               Hill 2007
                                   
    R9  3970  13928C                           Kong 2006, Metspalu 2006
                               
      R9b  1541                            
                               
        R9b1  12714  16309  16390                       Kong 2006 ("R9b"), Metspalu 2006 ("R9b"), Hill 2007 ("R9b")
                               
          R9b1a  183  (16192)                   AY255152, DQ981469  
                                 
            R9b1a1  143  4017  7849  16288               DQ981473, DQ981472  
                                 
              R9b1a1a  16234                 DQ981466, DQ981465  
                                 
          R9b1b  2322A  16124  16148                 DQ981470, EF114273  
                                 
        R9b2  3666  6647  8724  11299  11422  13191  13722  15314  15883  16362           DQ981474, DQ981475  
                                 
      R9c  951  6446  7861  8440  11002  11308  14227  15479  15734  16256  16335             GQ119010, GQ119007 Tabbada 2010, Hill 2007
                               
      F  249d  6392  10310                         Kong 2006, Kivisild 2006, Metspalu 2006, Tanaka 2004
                                 
        F1  6962  10609  12406  12882                     Kong 2003, 2006, Metspalu 2006
                                 
          F1a'c  9053  13759  16129                     Kong 2006, Metspalu 2006
                                 
            F1a  4086  16172                   Kong 2006
                                 
              F1a1  9548  16162               AP008667, AP008906 Kong 2006, Metspalu 2006
                               
                F1a1a  8149  16108             AY255175 Kong 2006
                               
                  F1a1a1  11215             AY963572, AY195791 Kong 2006
                               
                F1a1b  64  14002             AP008347, AP008279 Kong 2006
                               
                F1a1c  548  10211             AP008475, AP008774 Kong 2006
                               
                 16129!                 GU377084  
                                   
                F1a2  10034  16465             AY255164, DQ272124 Kong 2006
                               
                F1a3  8705  9554  9944  13748  15565  16284  16311  16390       AP008679, AP008701 Kong 2006
                               
            F1c  709  10454                 AY255177, AP010738 Kong 2006, Metspalu 2006
                               
             16189                       Kong 2006, Metspalu 2006
                                   
            F1b  152  10976  12633  14476  16232A  16249  16311             Kong 2006
                                 
              F1b1  4732  5147               AP008446, DQ272125 Kong 2006
                               
                F1b1a  16129  16344             AP008577, AP008498  
                                 
                  F1b1a1  15954             AP008591 Kong 2006
                               
                    F1b1a1a  5049           AP008421, AP010728  
                                 
                      F1b1a1a1  4705         AP010731, AP008713 Kong 2006
                               
                        F1b1a1a1a  14103A       AP009474, AP008820 Kong 2006
                               
                      F1b1a1a2  9389         AP010754, AP008490 Kong 2006
                               
            F1d  146  1734  5628  7738  15402               AP008328, AP008808 Kong 2006, Fornarino 2009
                               
            F1e  5587  15024                 EU597547  
                                 
              F1e1  3027  10007  12618  13260  13749  15022  15496  16355       AP008508, AP010837  
                                 
        F2  1005  1824  7828  10535  10586  12338  13708               AP010683 Kong 2006, Metspalu 2006
                               
          F2a  16203                     AP008692, AY255168 Kong 2006, Metspalu 2006
                               
        F3  3434  5585  5913  5978  10320  11065  16298  16304!  16362               Kong 2006
                                 
          F3a  12621  16355                   AY255167 Kong 2006, Metspalu 2006
                               
          F3b  9947  16220C                   AY972053 Kong 2006
                               
            F3b1  150  5076  6791  8838  11065!  15784  16311           GQ119009, GQ119015 Tabbada 2010
                               
        F4  5263  12630  15670                       Kong 2006, Metspalu 2006, Kivisild 2006
                                 
          F4a  146  3290  10915  12153  13602  16207  16362  16399             AF346973 Kong 2006, Metspalu 2006
                               
            F4a1  152  207  7861  11038  12396  12408  16497           AP008744, EU597565 Metspalu 2006
                               
          F4b  573.1CCC  6653  8020  8575  8603  10097C  16218  16311           AY289095, AY289096 Kong 2006, Metspalu 2006
                               
    R22  152  329  1040  6770  10316  10609  13359  16249  16288                 GQ301886, GQ301863 Hill 2006, 2007, Trivedi 2006 ("R12"), Peng 2010
                               
     16189                               Kong 2003, 2006, Metspalu 2006
                                   
    R11'B6  12950                             Soares 2009
                                 
      R11  185  189  709  8277  8278.1CC  10031  10398  11061  13681  16311             AY255163 Kong 2006, Kivisild 2006, Metspalu 2006
                               
        R11a  10978                       DQ112788 Kong 2006
                               
          R11a1  4706  9071  12358  (16365)                 AP010998, AY255147  
                                 
      B6  5894C  8281-8289d  9452  11914  13928C  14305  16093               AY255136, GQ119045 Yao 2004, Kong 2006, Reddy 2007 ("B7"), Soares 2009, Tabbada 2010 ("B7")
                               
    B4'5  8281-8289d                           Achilli 2008, Kong 2006, Metspalu 2006, Kivisild 2006, Tanaka 2004
                                 
      B4  16217                           Kong 2006, Trejaut 2005, Metspalu 2006, Achilli 2008
                                 
           16261                       EU597559 Trejaut 2005, Kong 2006, Metspalu 2006
                                 
          B4a  5465  9123                   AP008384, AP008567 Trejaut 2005, Kong 2006
                               
            B4a1  10238                     Trejaut 2005, Kong 2006, Metspalu 2006 ("B4a"), Kivisild 2006
                                 
              B4a1a  146  6719  12239  15746             DQ372871, AJ842749 Trejaut 2005, Kong 2006
                               
                B4a1a1  14022               AY289076, DQ372873 Trejaut 2005
                               
                  B4a1a1a  16247             EU597555, DQ372881 Trejaut 2005, Kong 2006 ("B4a1a1")
                               
                    B4a1a1a1  6905           AY289093, EU597531 Trejaut 2005, Kong 2006 ("B4a1a1a")
                               
                    B4a1a1a2  1473  3423A         FJ767912, FJ767911 Razafindrazaka 2009
                               
                    B4a1a1a3  1185  4769!           Benton 2009
                                 
                  B4a1a1b  15924             DQ372874, DQ372877  
                                 
                B4a1a2  4733  6366  12519             AJ842748, AJ842745 Kong 2006, Trejaut 2005
                               
                 16311                 EU597506  
                                   
                B4a1b  9932  10915  13143  16288           AP008595 Metspalu 2006 ("B4a1")
                               
                  B4a1b1  16268             AP008842 Trejaut 2005 ("B4a1b"), Kong 2006 ("B4a1b")
                               
                    B4a1b1a  9977           AF346993, AP008597 Kong 2006, Trejaut 2005
                               
              B4a1c  709                   Trejaut 2005, Kong 2006
                                 
                B4a1c1  9254               AP008912, AP008650 Kong 2006, Trejaut 2005, Metspalu 2006 ("B4a2")
                               
                   146                  
                                     
                  B4a1c2  7052  7271  9822A  15661  16167  16317       AY519495, AY519492 Kong 2006
                               
                  B4a1c4  12904             EU597505, DQ272120  
                                 
                B4a1c3  16194C  16195             AP008521  
                                 
                  B4a1c3a  310  3960  4203  5263  7927  15479  16000  16266G     AP010705, AP008412 Kong 2006 ("B4a1c3")
                               
            B4a2  6620  9812                 AP008257 Trejaut 2005, Kong 2006
                               
              B4a2a  4823  16324               AJ842750, AJ842751 Trejaut 2005, Kong 2006
                               
          B4g  5108  7789  9968  14905  16292               AY255133 Kong 2006
                               
        B4b'd'e  827  15535                       Kong 2006, Metspalu 2006, Achilli 2008, Perego 2009
                                 
          B4b  499  4820  13590                     Kong 2006, Metspalu 2006, Kivisild 2006, Achilli 2008, Perego 2009
                                 
            B2  3547  4977  6473  9950  11177               DQ282435, EF648602 Achilli 2008, Kong 2006, Metspalu 2006, Kivisild 2006, Perego 2009
                               
              B2a  16111  16483                 Achilli 2008
                                 
                B2a1  10895               EU431083, DQ282445 Achilli 2008
                               
                  B2a1a  14766!             DQ282444, EF657537 Achilli 2008
                               
                B2a2  9097               DQ282441, EF657306  
                                 
              B2b  6755                 EU095532, EU095210 Achilli 2008, Fagundes 2008
                               
              B2c  7241                 DQ282436, EF657349 Achilli 2008
                               
                B2c1  9098               DQ282438, DQ282440 Achilli 2008
                               
              B2d  4122  4123  8875  9682             EU095550, AY195749 Tamm 2007, Achilli 2008
                               
              B2e  6119  14049               EU597569, DQ112790  
                                 
              B2f  3796  3996  10535  13833             EU334872, EF657347  
                                 
              B2g  (114G)  1002  3766  6164  (16298)  (16362)           HM161643, EF657340  
                                 
              B2h  11821  16468               EU095206, EU095215 Fagundes 2008
                               
                 16311                 EU095535  
                                   
                B2i  430  485  961  6272             EU095218, EU095217 Fagundes 2008
                               
            B4b1  16136                     Kong 2006, Metspalu 2006, Achilli 2008
                                 
              B4b1a  6023  6413               AY519494 Kong 2006, Metspalu 2006, Achilli 2008
                               
                   207                  
                                     
                  B4b1a1  199  202  2831  4117  8206  15236  16284       AP008325, AP010735 Kong 2006
                               
                    B4b1a1a  7664           AP008665, AP009471 Kong 2006
                               
                  B4b1a2  6216             EU597553, AP008856 Kong 2006, Achilli 2008
                               
                    B4b1a2a  1719  2220  5899.1C         AY255170, AP010671 Kong 2006
                               
              B4b1b'c  16218                   Kong 2006
                                 
                B4b1b  152  1391  3981  5585  13934  14569  16298  16362       AP008550, AP008682 Kong 2006, Metspalu 2006
                               
                B4b1c  14587               DQ272119, AP009450 Kong 2006
                               
          B4d  11914  13942                   AP008492 Metspalu 2006
                               
            B4d1'2'3  15930                   AY519484 Metspalu 2006, Kong 2006 ("B4d")
                               
              B4d1  316  15038               AY255135, AP010835 Metspalu 2006, Nohira 2010
                               
              B4d2  6722  8379  8855  9701  15512             AY255140 Metspalu 2006
                               
              B4d3  151  546  5084  5418  9120  12135  16150  16185  16234       AP008712, AP010836 Metspalu 2006, Tanaka 2004 ("B4d"), Nohira 2010 ("B4d2")
                               
          B4e  146  185  189  195  196  348G  1719  4048  4926  5460  6026  6614  9288  9921  10750  12358  14133  16291   AP008436 Tanaka 2004, Metspalu 2006
                               
        B4c  1119  15346                       Kong 2006, Metspalu 2006
                                 
          B4c1  3497  16311                     Kong 2006, Metspalu 2006
                                 
            B4c1a'b  709                     Kong 2006, Metspalu 2006
                                 
              B4c1a  10310  14133               AP010696, AP008603 Kong 2006, Metspalu 2006
                               
                   16086               AP008482, AP008540  
                                   
                  B4c1a1  8844             AP008298 Kong 2006
                               
                    B4c1a1a  5592  16129         AP008604, AP008516 Kong 2006
                               
                  B4c1a2  6164             AP008688, AP008470 Kong 2006
                               
              B4c1b  150  16140  16274  16311!             AP008472, AP008570 Kong 2006, Metspalu 2006
                               
                B4c1b1  211  455.1T  3221  4742  5826  7909  13879  14162  16111  16154  16497   AP008899 Kong 2006
                               
                  B4c1b1a  8167A  15148  15391         AP008393, AP008831 Kong 2006
                               
                B4c1b2  146  3571  8772             AY255149 Kong 2006
                               
                  B4c1b2a  1709  1716           GQ161177, AP010718  
                                 
            B4c1c  150  195  5441  10398  13629  15941             AP009436, AP009461  
                                 
              B4c1c1  214                 AP008450, AP008563 Kong 2006 ("B4c1c"), Metspalu 2006 ("B4c1c")
                               
          B4c2  5108  14088  14209  16147  16184A  16235               GU592216, GU592219 Wen 2005 ("B4e"), Kong 2006, Metspalu 2006, Peng 2010
                               
            B4c2a  9103                   AF347011, AY289100 Kong 2006
                               
        B4f  200  1442  4612  5127  6332  7389  11969  13105  16168  16172  16249  16325  16390         AP008788 Kong 2006, Metspalu 2006
                               
          B4f1  257  8291  16523                   AP008262, AP008879 Kong 2006
                               
      B5  709  8584  9950  10398  16140                       Kong 2006, Metspalu 2006
                                 
        B5a  210  3537  15235  16266A                     Kong 2006, Metspalu 2006
                                 
          B5a1  6960                     DQ834254 Kong 2006
                               
            B5a1a  13145  13395                 EU597566 Kong 2006
                               
              B5a1a1  11881                 AY950286, AY950287  
                                 
            B5a1b  10754  14989                 AY255145, GQ119031 Tabbada 2010
                               
          B5a2  93  9962  11149  11151  14149  (16266G)               DQ372869  
                                 
            B5a2a  12234  16187                 EF114286, AP008263 Kong 2006 ("B5a2")
                               
        B5b  103  204  1598  8829  12361  15223  15508  15662  15851  15927  16243             Kong 2006, Metspalu 2006, Kivisild 2006
                                 
          B5b1  (960.1C)  8784                   AP010771, AP008284  
                                 
            B5b1a'b  11146  14470                   Kong 2006 ("B5b1"), Metspalu 2006 ("B5b1")
                                 
              B5b1a  103!  195  16278  16324             AP008827, AP008631 Kong 2006
                               
              B5b1b  199  11914  12192  16223  16318T  16319           AP008518, AP010686 Kong 2006, Metspalu 2006 ("B5b1a")
                               
            B5b1c  152  1555  3395  3480  3819  5836  7771  8467  10274  15514  15712  15966d  16113C  16149C   GQ119020 Tabbada 2010
                               
          B5b2  4895  15850  16111  16234  16463                 Kong 2006, Metspalu 2006
                                 
            B5b2a'b  103!  131                   AY519489 Kong 2006
                               
              B5b2a  5744  11437  16291               AY255179, AP008737 Kong 2006
                               
              B5b2b  207  15758               AP008846, AP008371 Kong 2006
                               
                B5b2b1  8894T  14750             AP008910, AP008491 Kong 2006
                               
            B5b2c  204!  481  2361  4161  9299  11101  12451             AP008584, AP008465 Kong 2006
                               
          B5b3  189  203  2626  6962  8856  10103               AP008566, AP010761 Metspalu 2006
                               
    R24  146  3565  4260  8772  9759  11710  12483  13434  14902  16051  16185  16324             GQ119037, GQ119033 Tabbada 2010
                               
  R12'21  10398  11404  16295                              
                                   
    R12  4011  4200  4695  4703  5417  8027  8906  9386  9644  9881  12172  13708  13759  14305  14989  15562  15884         DQ112752 Kivisild 2006, Pierson 2006, Hudjashov 2007
                               
    R21  146  152  195  199  249  1709  1719  1872  2397  4711  8279  9067  9077  9109  10610T  11002  12234  12361  12510  13145  15613  16168  16304   AY963584 Macaulay 2005, Pierson 2006, Hill 2006, 2007
                               
  R14  56T  182  204  234  573.1CCC  4002  7022G  8860!  9128  10172  11321  11560  12612  13281  14002  14800  15394  15458  16187  16288  16304G  16362   EF495216 Hudjashov 2007
                               
  R23  195  634A  6216  7007  7158  7388  7822  8614  10987  11914  12151  12459  13885A  14687  15412  16256  16290  16465       GQ301864 Hill 2007, Peng 2010
                               
  R30  (152)  8584                           AY714006 Chaubey 2008a, Palanichamy 2004, Fornarino 2009
                               
    R30a  2056  3316  4232  5442  6764  9156  9242  11047A  12714  15055                 AY714001, FJ004824 Chaubey 2008a, Fornarino 2009
                               
    R30b  373                           EF556148  
                                 
      R30b1  299d  480  1598  4062  4225  5836  7268G  7490  8805  9174  10631A  11009  12406  13236  14194  14305  15307  16189  16298  16299   FJ004827, AY714047 Chaubey 2008a ("R30b"), Fornarino 2009
                               
  R31  15884  (16362)                             Chaubey 2008a, Palanichamy 2004
                                 
    R31a  146  338  1531  5348  6293  6480  7981  10373  10631  13557  13768A  14553  15334  16172  16304         AY714021 Chaubey 2008a
                               
      R31a1  152  237  2248  8842  14290  16463                   FJ004825, FJ004826 Chaubey 2008a
                               
    R31b  207  228  234  1309  1452  2763  3849  3882  5503  6827  7046  8400  8988  12007  12651  14488  15148  16051  16093  16189  16218  16292   AY714046, AY714048 Chaubey 2008a, Palanichamy 2004
                               
  P  15607                               Friedlaender 2005, 2007, Hudjashov 2007, Palanichamy 2004, van Holst Pellekaan 2006
                                 
       16176                             Hudjashov 2007
                                   
      P1  212  6077  10118  16266  16357                     AF347004, AF347002 Friedlaender 2005, 2007, Hudjashov 2007
                               
        P1d  12346                       AY289092  
                                 
          P1d1  16270                     EU597507, AY289087  
                                 
      P2'10  3882                           Tabbada 2010
                                 
        P2  1438!  3203  4122  8859  14890  16176!                 DQ112897, AY289088 Hudjashov 2007, Friedlaender 2007
                               
        P10  710  1673  3738  4314  5915  6131  6446  6740  6773  8158T  8664  9077  11914  12642  13810  13958C  14783  15811  15839  15924  16145  16224  16233  16311  16456  16527   GQ119036 Tabbada 2010
                               
      P9  152  3391  5237  7805  8167  8614  11065  11353  11404  12414  12756  15110  15511  15521C  16241T  16261  16362     DQ404446 Hudjashov 2007, van Holst Pellekaan 2006 ("P8")
                               
    P3  127  128  573.1CCC  3645  14338  15748  15937T                     Friedlaender 2007, Hudjashov 2007
                               
      P3a  125  5899d  6734  13651  16145  16278                   AY289052, AY289065  
                               
      P3b  236  12121  13934                       AY289091  
                                 
        P3b1  152  259  263!  574C  576C  14053  15937C  16327  16399             EF061153, EF061154  
                                 
    P4  1719  5460  10398                           Hudjashov 2007, Friedlaender 2007, van Holst Pellekaan 2006
                                 
      P4a  152  507  517  3915  4216  7852  9587  9755  10463  11167  11641  12358  13135  14512  15314  16319       EF061158, EF061159 Hudjashov 2007, Friedlaender 2007
                               
        P4a1  4814  13468  14696                     EF495221, EF061156 Hudjashov 2007
                               
      P4b  10914  11016  11288  16274  16291                   AY289064 Hudjashov 2007, Friedlaender 2007
                               
        P4b1  591A  3010  5276  5460!  6881  10088  16337  16362               DQ404444, AY289057  
                                 
    P5  152  1438!  7419  7657  9509  12406  12831  13368  15412  15970  16192  16311             AY289063 Friedlaender 2005, Hudjashov 2007
                               
    P6  6719  16311  16362                         AY289053, AY289055 Friedlaender 2005, Hudjashov 2007
                               
    P7  152  374  1598  2283  6249  7325  8387  10373  10810  12026  12235  12361  14502  15613  16148  16234         AY289054 Friedlaender 2005, Hudjashov 2007, Pierson 2006
                               
    P8  3172A  6392  11050  12864  13338  13452A  14788  16192  16278  16325               GQ119026 Tabbada 2010
                               
  U  11467  12308  12372                             Achilli 2005, Palanichamy 2004