- mtDNA tree Build 17 (18 Feb 2016): subtree N2
Citation: van Oven M, Kayser M. 2009. Updated comprehensive phylogenetic tree of global human mitochondrial DNA variation. Hum Mutat 30(2):E386-E394.
Nucleotide position numbers are consistent with both the rCRS and the RSRS reference sequences.
Mutations are given in forward evolutionary time direction in the format [ancestral base][position number][derived base], e.g. "G15043A".
In case of a transversion, the derived allele is shown in lowercase instead of uppercase, e.g. "C5178a".
Insertions are indicated by the position number preceding the insertion followed by a dot (.), the relative insert position, and the inserted base(s), e.g. "2156.1A".
Deletions are indicated by the letter "d" following the (range of) position number(s) involved, e.g. "A249d" or "8281-8289d".
Mutations that are reversions to an ancestral state (back mutations) are indicated with an exclamation mark (!), two exclamation marks for a double back mutation (!!), etc., e.g. "A15301G!".
Coding-region mutations (np 577-16023) are shown in black; control-region mutations (np 16024-576) in blue.
Mutations between brackets () are recurrent/unstable within the respective clade, or are yet uncertain based on current data.
Mutation motifs in italic are preliminary and are likely to be further refined as additional sequences become available.
The mutations 309.1C(C), 315.1C, AC indels at 515-522, A16182c, A16183c, 16193.1C(C) and C16519T/T16519C were not considered for phylogenetic reconstruction and are therefore excluded from the tree.
Accession numbers provided at the tips of branches are representative examples of mtDNA sequences available at GenBank or from individuals included in HapMap/1000Genomes.
It may be convenient to use the Find function (Ctrl+F) of your browser to search for a particular mutation or haplogroup.
                                      Example accessions
 mt-MRCA (RSRS)                                  
L1'2'3'4'5'6  C146T  C182T  T4312C  T10664C  C10915T  A11914G  G13276A  G16230A                       
  L2'3'4'5'6  C152T  A2758G  C2885T  G7146A  T8468C                           
    L2'3'4'6  C195T  A247G  A825t  T8655C  A10688G  C10810T  G13105A  T13506C  G15301A  A16129G  T16187C  C16189T             
      L3'4'6  G4104A  A7521G                           
        L3'4  T182C!  T3594C  T7256C  T13650C  T16278C                     
          L3  A769G  A1018G  C16311T                     
            N  G8701A  C9540T  G10398A  C10873T  A15301G!               
              R  T12705C  T16223C                   
                R0  G73A  A11719G                 
                  HV  T14766C                 
                    H  G2706A  T7028C             
                      H2  G1438A             
                        H2a  G4769A           
                          H2a2  G750A         
                            H2a2a  G8860A  G15326A     
                              H2a2a1  G263A      rCRS
              N2  A189G  G709A  G5046A  C11674T  T12414C               
                N2a  T199C  C739T  T7581C  G15106A  G16153A  G16319A            EU787451 JF904935
                  N2a1  A14152G  C16111T                KC911573 JF930639
                  N2a2  A4065G                  JN207845 KC911368
                W  T195C!  T204C  G207A  T1243C  A3505G  G5460A  G8251A  G8994A  A11947G  G15884c  C16292T    KF056262
                  W1  C7864T                  JQ702793 KF146268
                    W1a  T5495C  C12669T              AY339475 AY339491
                    W1b  A227G  T4928C  G9612A            AY339462 AY339465
                      W1b1  A10086G              AY339466 JQ702545
                       T119C                FJ472633 JQ705036
                      W1c  A14148G              JQ702450 JQ245768
                        W1c1  T11204C  A12648G  C16184T        JQ702327 JQ704790
                      W1i  T5580C              KF146267 JQ702332
                    W1d  G189A!  C194T  A200G  T8383C  C9278T  A14981c  C16260T  T16292C!  T16298C  EF556154
                    W1e  A8659G  A8887G              JQ705839
                      W1e1  C16295T              FJ543390 HM625692
                        W1e1a  A10398G!  T16324C          JQ702638 KF146263
                    W1f  T9950C                FJ384432 FJ348225
                    W1g  C16320T                JQ702249 JQ704975
                    W1h  G16145A                JQ898579 KF146270
                      W1h1  G513c              JQ703970 KF146271
                     C194T                  EU086510
                    W3  T1406C               
                      W3a  T15784C              JQ705313
                        W3a1  A13263G            KF146273 JQ245760
                          W3a1a  C7151T         
                            W3a1a1  G3421A        JQ705286 FJ472839
                            W3a1a2  G5585A  A9127G      GU123000 JQ705642
                            W3a1a3  T15109C        FJ821289 EF657508
                          W3a1b  T10245C          GU002155 AY714043
                            W3a1c  G7269A        JQ703058 JQ702804
                            W3a1d  A10398G        KF142470 JQ704160
                        W3a2  T5291C  T16209C  G16255A        JQ705487 GU147938
                      W3b  T199C  G12923t            KF146279 JQ245743
                        W3b1  G189A!  T7058C          JQ701824 JQ702298
                    W4  G143A  T196C  (C16286T)            KF146281
                      W4a  T192C              AY714018
                        W4a1  G3531A  T16292C!          HM034304 EU400619
                      W4b  G7444A              KF146280 FJ348217
                      W4c  G11947A!              KF146282 NA20503
                      W4d  C16082T              KF146283 JQ245758
                    W5  C6528T  A15775G              KF146285 KC911419
                      W5a  A10097G  T16362C            JQ701827
                        W5a1  T10410C            JN583886
                          W5a1a  T4363C          EF652811 KF146284
                            W5a1a1  A9275G        JF431251 EU135972
                              W5a1a1a  T57C  60.1T  T139C    HM057816 GU828018
                        W5a2  C150T            HG00148 GU726895
                          W5a2b  T3644C  A16177G        JQ705278 JF419335
                      W5b  60.1TT  64-65d  G11696A          JQ703283
                        W5b1  T58C  G66c          EU744586
                          W5b1a  C195T!!  T8618C  A9809G      JQ701912 JX153968
                    W6  A4093G  T8614C  (C16192T)  T16325C          JQ245723 KF146287
                      W6a  T8610C              NA20804 JQ705209
                      W6b  T4646C  T6297C  T8705C          JQ245761 FJ473381
                        W6b1  G7269A            JQ245728 KF146290
                      W6c  C8002T  C8658T            JF275845
                        W6c1  A8149G            KF700922
                          W6c1a  C16211T          KF553923 EU515252
                      W6d  C9211T              KF146288 JQ245762
                    W7  G185A                HM352797 JQ702147
                    W8  G5147A  G8697A              NA19776 JQ245778
                    W9  C14097T                JQ245759 JQ702358