| PhyloTree.org - mtDNA tree Build 17 (18 Feb 2016): subtree M8 | |||||||||||||||||||||||
| Citation: van Oven M, Kayser M. 2009. Updated comprehensive phylogenetic tree of global human mitochondrial DNA variation. Hum Mutat 30(2):E386-E394. | |||||||||||||||||||||||
| Nucleotide position numbers are consistent with both the rCRS and the RSRS reference sequences. | |||||||||||||||||||||||
| Mutations are given in forward evolutionary time direction in the format [ancestral base][position number][derived base], e.g. "G15043A". | |||||||||||||||||||||||
| In case of a transversion, the derived allele is shown in lowercase instead of uppercase, e.g. "C5178a". | |||||||||||||||||||||||
| Insertions are indicated by the position number preceding the insertion followed by a dot (.), the relative insert position, and the inserted base(s), e.g. "2156.1A". | |||||||||||||||||||||||
| Deletions are indicated by the letter "d" following the (range of) position number(s) involved, e.g. "A249d" or "8281-8289d". | |||||||||||||||||||||||
| Mutations that are reversions to an ancestral state (back mutations) are indicated with an exclamation mark (!), two exclamation marks for a double back mutation (!!), etc., e.g. "A15301G!". | |||||||||||||||||||||||
| Coding-region mutations (np 577-16023) are shown in black; control-region mutations (np 16024-576) in blue. | |||||||||||||||||||||||
| Mutations between brackets () are recurrent/unstable within the respective clade, or are yet uncertain based on current data. | |||||||||||||||||||||||
| Mutation motifs in italic are preliminary and are likely to be further refined as additional sequences become available. | |||||||||||||||||||||||
| The mutations 309.1C(C), 315.1C, AC indels at 515-522, A16182c, A16183c, 16193.1C(C) and C16519T/T16519C were not considered for phylogenetic reconstruction and are therefore excluded from the tree. | |||||||||||||||||||||||
| Accession numbers provided at the tips of branches are representative examples of mtDNA sequences available at GenBank or from individuals included in HapMap/1000Genomes. | |||||||||||||||||||||||
| It may be convenient to use the Find function (Ctrl+F) of your browser to search for a particular mutation or haplogroup. | |||||||||||||||||||||||
| Example accessions | |||||||||||||||||||||||
| mt-MRCA (RSRS) | |||||||||||||||||||||||
| L1'2'3'4'5'6 | C146T C182T T4312C T10664C C10915T A11914G G13276A G16230A | ||||||||||||||||||||||
| L2'3'4'5'6 | C152T A2758G C2885T G7146A T8468C | ||||||||||||||||||||||
| L2'3'4'6 | C195T A247G A825t T8655C A10688G C10810T G13105A T13506C G15301A A16129G T16187C C16189T | ||||||||||||||||||||||
| L3'4'6 | G4104A A7521G | ||||||||||||||||||||||
| L3'4 | T182C! T3594C T7256C T13650C T16278C | ||||||||||||||||||||||
| L3 | A769G A1018G C16311T | ||||||||||||||||||||||
| N | G8701A C9540T G10398A C10873T A15301G! | ||||||||||||||||||||||
| R | T12705C T16223C | ||||||||||||||||||||||
| R0 | G73A A11719G | ||||||||||||||||||||||
| HV | T14766C | ||||||||||||||||||||||
| H | G2706A T7028C | ||||||||||||||||||||||
| H2 | G1438A | ||||||||||||||||||||||
| H2a | G4769A | ||||||||||||||||||||||
| H2a2 | G750A | ||||||||||||||||||||||
| H2a2a | G8860A G15326A | ||||||||||||||||||||||
| H2a2a1 | G263A | rCRS | |||||||||||||||||||||
| M | T489C C10400T T14783C G15043A | ||||||||||||||||||||||
| M8 | A4715G C7196a G8584A A15487t T16298C | ||||||||||||||||||||||
| M8a | G6179A C8684T T14470C G16319A | ||||||||||||||||||||||
| M8a1 | A8453G G15047A G15148A G15355A T15697C (T16086C) | KF148510 | |||||||||||||||||||||
| M8a1a | T6719C T16311C! | AP008705 | AP008823 | ||||||||||||||||||||
| M8a2'3 | C16184T | ||||||||||||||||||||||
| M8a2 | C2835T | NA18538 | FJ198227 | ||||||||||||||||||||
| T152C! | AP008531 | ||||||||||||||||||||||
| M8a2a | G11176A T16189C! | JF824924 | |||||||||||||||||||||
| M8a2a1 | G16470A G16471A | AP008803 | AY255150 | ||||||||||||||||||||
| M8a2b | C4670T T6671C A13050G | AP008373 | EU219349 | ||||||||||||||||||||
| M8a2c | A15244G | AP008727 | KF849960 | ||||||||||||||||||||
| M8a2d | A234G T9861C G10646A T12375C C13993T | KC251743 | AY255161 | ||||||||||||||||||||
| M8a2e | G15217A | NA18105 | KF540552 | ||||||||||||||||||||
| M8a3 | C5100T | NA18646 | HM460791 | ||||||||||||||||||||
| M8a3a | C16134T | KF849919 | KF849962 | ||||||||||||||||||||
| M8a3a1 | T9758C | KF849902 | JF824830 | ||||||||||||||||||||
| CZ | A249d | ||||||||||||||||||||||
| C | T3552a A9545G G11914A! A13263G T14318C C16327T | ||||||||||||||||||||||
| C1 | 290-291d T16325C | ||||||||||||||||||||||
| C1a | T3826C G7598A T16356C | AY519496 | EU007858 | ||||||||||||||||||||
| C1b | A493G | NA19726 | EU095226 | ||||||||||||||||||||
| C1b1 | T11147C | AY195759 | HQ012193 | ||||||||||||||||||||
| C1b2 | G263A C4242T G7013A C9557T G12454A | DQ282447 | JN546585 | ||||||||||||||||||||
| C1b3 | G12630A | DQ282464 | NA19788 | ||||||||||||||||||||
| C1b4 | G143A G1438A C4167T A14524G T16086C T16189C! C16278T! | EU431085 | DQ282475 | ||||||||||||||||||||
| C1b5 | A11989G G15119A | ||||||||||||||||||||||
| C1b5a | T1005C | HQ012213 | DQ282469 | ||||||||||||||||||||
| C1b5b | C5157T T16249C | JQ702595 | JQ702534 | ||||||||||||||||||||
| C1b6 | T8848C T13326C T16271C T16357C | EU095229 | EU095230 | ||||||||||||||||||||
| T16311C! | |||||||||||||||||||||||
| C1b7 | T13635C | HQ012207 | HQ012196 | ||||||||||||||||||||
| C1b7a | T15470C | NA19762 | HQ012215 | ||||||||||||||||||||
| C1b10 | T146C! A385G A6284G G16129A! T16172C | HQ012198 | HQ012188 | ||||||||||||||||||||
| C1b8 | A15613G T16362C | HQ012236 | |||||||||||||||||||||
| C1b8a | G3736A A4381G T4911g C9130T A11812G | HQ012210 | HQ012202 | ||||||||||||||||||||
| C1b9 | T6297C T8047C | HQ012212 | JQ702984 | ||||||||||||||||||||
| C1b11 | C16295T | JQ705451 | JQ701891 | ||||||||||||||||||||
| C1b12 | T11025C | JQ705153 | HQ012197 | ||||||||||||||||||||
| C1b13 | C258T A7091G | JX413055 | JX413056 | ||||||||||||||||||||
| C1b13a | T1193C | JX413039 | |||||||||||||||||||||
| C1b13a1 | A11084G C12411T | JX413038 | JX413036 | ||||||||||||||||||||
| C1b13b | A1842G T10101C | JX413042 | JX413041 | ||||||||||||||||||||
| C1b13c | A15244G | JX413044 | |||||||||||||||||||||
| C1b13c1 | T13392C | JX413046 | JX413048 | ||||||||||||||||||||
| C1b13d | T13965C A16051G | JX413049 | JX413050 | ||||||||||||||||||||
| C1b13e | C14944T | JX413051 | JX413052 | ||||||||||||||||||||
| C1b14 | A5894G A10397G A16181G | NA19773 | HQ012208 | ||||||||||||||||||||
| C1c | G1888A G15930A | DQ282459 | JQ703840 | ||||||||||||||||||||
| C1c1 | A215G | HQ012229 | |||||||||||||||||||||
| C1c1a | A12978G | EU597533 | EF657324 | ||||||||||||||||||||
| C1c1b | G5773A | JQ705676 | JQ704902 | ||||||||||||||||||||
| C1c2 | G3010A G11440A T11794C C14356T | DQ282466 | HQ012232 | ||||||||||||||||||||
| C1c3 | A3140G G3705A T6815C T7022a T15670C A16265G G16319A | JQ705761 | EU095544 | ||||||||||||||||||||
| C1c4 | A214G G16274A | HQ012220 | EF079875 | ||||||||||||||||||||
| C1c5 | T11617C G16526A | DQ282465 | HQ012230 | ||||||||||||||||||||
| T195C! | |||||||||||||||||||||||
| C1c6 | T12414C G16153A | JQ704040 | JQ705574 | ||||||||||||||||||||
| C1c7 | G1303A G9932A T16092C C16176T C16218T | JQ703827 | HQ012223 | ||||||||||||||||||||
| C1c8 | A9254G C16114T | EU327891 | EU431087 | ||||||||||||||||||||
| C1d | A16051G | HQ012239 | HM107306 | ||||||||||||||||||||
| C194T | HM107317 | HM107309 | |||||||||||||||||||||
| C1d1 | G7697A | HM107365 | HG01462 | ||||||||||||||||||||
| C1d1a | T194C! G1415A A7343G | HM107321 | |||||||||||||||||||||
| C1d1a1 | T6297C G14305A | HM107319 | HM107320 | ||||||||||||||||||||
| C1d1b | T195C! A928G | HM107324 | |||||||||||||||||||||
| C1d1b1 | G7337A | HM107326 | HM107332 | ||||||||||||||||||||
| C1d1c | C16188T T16362C | HM107334 | |||||||||||||||||||||
| C1d1c1 | T194C! C16298T! | HQ012235 | DQ282473 | ||||||||||||||||||||
| C1d1d | T16172C | HM107355 | EU095537 | ||||||||||||||||||||
| C1d2 | C10834T | HM107315 | |||||||||||||||||||||
| C1d2a | T593C T16209C | HM107314 | HM107313 | ||||||||||||||||||||
| C1d3 | C12378T T16140C T16288C | JQ701741 | |||||||||||||||||||||
| C1e | T152C! C534T A3395G C3507T 5899.XC C7331T A13651G A13966G T14324C A15613G T16311C! | ||||||||||||||||||||||
| C1f | G247A! | HM804483 | |||||||||||||||||||||
| C4 | G6026A G11969A T15204C | FJ951604 | |||||||||||||||||||||
| C4a'b'c | 2232.1A | ||||||||||||||||||||||
| C4a | A12672G | ||||||||||||||||||||||
| C4a1 | T7999C (T16093C) (G16129A!) | KC911332 | |||||||||||||||||||||
| C4a1a | C1715T T15968C | FJ951462 | |||||||||||||||||||||
| C4a1a1 | 2232.2A A8508G | JX266268 | |||||||||||||||||||||
| C4a1a1a | C3576T A4884G A4958G | FJ383648 | FJ383597 | ||||||||||||||||||||
| T195C! | FJ951601 | EU597517 | |||||||||||||||||||||
| C4a1a2 | A10891G | JF824987 | KF849915 | ||||||||||||||||||||
| C4a1a2a | G10685A | AY255174 | HG00428 | ||||||||||||||||||||
| C4a1a3 | A15607G | FJ951442 | KF148492 | ||||||||||||||||||||
| C4a1a3a | A8389G | FJ951463 | FJ951533 | ||||||||||||||||||||
| C4a1a3a1 | C11476T | EU482371 | AY615360 | ||||||||||||||||||||
| C4a1a3b | A12397G | EU482380 | FJ951552 | ||||||||||||||||||||
| C4a1a3c | A3796G | KF148505 | KF148229 | ||||||||||||||||||||
| C4a1a3d | C16298T! | KF148121 | KF148106 | ||||||||||||||||||||
| C4a1a4 | G12940A | FJ951459 | |||||||||||||||||||||
| C4a1a4a | C16150T | EU482361 | FJ951607 | ||||||||||||||||||||
| C4a1a5 | T4080C G5460A G6261A | FJ951612 | HM036567 | ||||||||||||||||||||
| C4a1a6 | T6221C | FJ951475 | FJ951539 | ||||||||||||||||||||
| C4a1b | C5846T C16192T | GU392063 | HQ260971 | ||||||||||||||||||||
| C4a2 | T16357C | ||||||||||||||||||||||
| C4a2a | G8485A T8793C C16344T | KF148092 | |||||||||||||||||||||
| C4a2a1 | A16171G | EU007861 | KF148221 | ||||||||||||||||||||
| C4a2a1a | A8869G | EU482323 | KF148332 | ||||||||||||||||||||
| C4a2a1b | A8014G A9263G | KF148469 | AF346979 | ||||||||||||||||||||
| C4a2b | T2887C T4696C T12624C | GQ895170 | |||||||||||||||||||||
| C4a2b1 | A5036G T16086C C16278T! | FJ383631 | FJ383634 | ||||||||||||||||||||
| C4a2b2 | T310C C1677T T10304C T16311C! | NA18547 | |||||||||||||||||||||
| C4a2b2a | G3745A 5899.1C C11155T A13563G | KF056249 | KF056247 | ||||||||||||||||||||
| C4a2c | G47A T3394C C13967T | FJ951548 | |||||||||||||||||||||
| C4a2c1 | G207A A6929G T10724C G13145A C16239T | FJ383607 | FJ383616 | ||||||||||||||||||||
| C4a2c2 | G15326A T16086C | FJ383647 | |||||||||||||||||||||
| C4a2c2a | C14668T | HM036530 | HM036554 | ||||||||||||||||||||
| C4b | A3816G | EU482314 | FJ951445 | ||||||||||||||||||||
| C4b1 | T146C! G8251A | FJ951476 | EU482304 | ||||||||||||||||||||
| C4b1a | T710C 16259.1A | AY570526 | FJ951512 | ||||||||||||||||||||
| C4b1b | G8292A | KF148250 | FJ951497 | ||||||||||||||||||||
| C4b2 | T16124C | KF148135 | |||||||||||||||||||||
| C4b2a | A16318t | FJ951598 | EU482333 | ||||||||||||||||||||
| C4b3 | C16291T | KF148478 | FJ951447 | ||||||||||||||||||||
| C4b3a | C15145T | EU482310 | KF148111 | ||||||||||||||||||||
| C4b3a1 | A16399G | EU482324 | EU482315 | ||||||||||||||||||||
| C4b3b | C9248T T16249C | AF346970 | KF148228 | ||||||||||||||||||||
| C4b5 | G11377A | FJ951580 | FJ951460 | ||||||||||||||||||||
| C4b6 | C1788T | FJ951451 | EU482375 | ||||||||||||||||||||
| C4b7 | A4136G A15924G | EU482313 | EU482326 | ||||||||||||||||||||
| C4b8 | G3392c | KF148472 | |||||||||||||||||||||
| C4b8a | T11254C T16093C | EU482370 | AY519490 | ||||||||||||||||||||
| C4c | C14433T G15148A | EU095543 | |||||||||||||||||||||
| C4c1 | T1243C | JF979205 | GU215075 | ||||||||||||||||||||
| C4c1a | T15629C A16241G | JQ705814 | JF979198 | ||||||||||||||||||||
| C4c1b | T16189C! | JF979202 | JF979203 | ||||||||||||||||||||
| C4c2 | G73A C96T 105-110d C114T A189G C473T G1438A C15523T | JQ705381 | JF979210 | ||||||||||||||||||||
| T152C! | |||||||||||||||||||||||
| T16093C | GQ895156 | ||||||||||||||||||||||
| C4d | A7100G A12780G A15236G | NA18631 | GQ895155 | ||||||||||||||||||||
| C4e | C151T A7307G T15479C | FJ951611 | FJ951610 | ||||||||||||||||||||
| C5 | 595.1C T16288C | ||||||||||||||||||||||
| C5a | G3591A C16261T T16327C! | ||||||||||||||||||||||
| C5a1 | C4904T C8140T | FJ951515 | FJ951439 | ||||||||||||||||||||
| C5a2 | T10084C A11928G T16093C | ||||||||||||||||||||||
| C5a2a | G1462A | FJ951457 | KF148083 | ||||||||||||||||||||
| C5a2b | T16189C! | EU482306 | EU482328 | ||||||||||||||||||||
| C5a2b1 | A8440G | KF148150 | FJ951595 | ||||||||||||||||||||
| C5b | 1719.1G | FJ951454 | |||||||||||||||||||||
| C5b1 | C16148T | FJ951472 | HM036577 | ||||||||||||||||||||
| C5b1a | A3397G T9233C | FJ951441 | FJ951566 | ||||||||||||||||||||
| C5b1a1 | G1719A | AY615359 | FJ951464 | ||||||||||||||||||||
| C5b1b | T4937C A14344G G15734A A16164G | FJ951496 | |||||||||||||||||||||
| C5b1b1 | T15055C | KF148480 | FJ951438 | ||||||||||||||||||||
| T16093C | AP008664 | NA18566 | |||||||||||||||||||||
| C5c | T10454C G16518t C16527T | FJ951614 | KC911293 | ||||||||||||||||||||
| C16234T | KC911629 | ||||||||||||||||||||||
| C5c1 | A1670t | FJ951452 | |||||||||||||||||||||
| C5c1a | C7694T | JN315676 | FJ951605 | ||||||||||||||||||||
| C5d | A15080G | ||||||||||||||||||||||
| C5d1 | G1415A A8188G G16390A | FJ951440 | EU482303 | ||||||||||||||||||||
| C5d2 | A10682G G13968A | FJ951576 | JF824965 | ||||||||||||||||||||
| C7 | G5821A A6338G | FJ951594 | KF849951 | ||||||||||||||||||||
| C7a | G7853A | FJ748711 | GU810045 | ||||||||||||||||||||
| C7a1 | T146C! T12957C A14978G | ||||||||||||||||||||||
| C7a1a | A153G A10295G | ||||||||||||||||||||||
| C7a1a1 | C151T T333C A6791G C16298T! | FJ383630 | |||||||||||||||||||||
| C7a1a2 | T3345C G7598A T12477C G13708A T16311C! | FJ383627 | FJ383622 | ||||||||||||||||||||
| C7a1c | T4047C C5987T | FJ951563 | AY255176 | ||||||||||||||||||||
| C7a1d | A2905G T11204C C16242T C16256T | FJ383636 | |||||||||||||||||||||
| C7a2 | 2232.1A T16189C! | JF896797 | |||||||||||||||||||||
| C7a2a | A12810G A12909G T13635g T14470C | EF429136 | KC251742 | ||||||||||||||||||||
| A16051G | FJ951540 | ||||||||||||||||||||||
| C7b | T5918C A11101G G15928A | FJ383641 | JF903929 | ||||||||||||||||||||
| Z | A6752G T9090C T15784C C16185T C16260T | ||||||||||||||||||||||
| T152C! | |||||||||||||||||||||||
| Z1 | G15261A | AY519493 | |||||||||||||||||||||
| Z1a | C151T G10325A G16129A! T16224C | FJ147318 | |||||||||||||||||||||
| Z1a1 | A9494G | ||||||||||||||||||||||
| Z1a1a | G740A A12930G | FJ493512 | DQ902711 | ||||||||||||||||||||
| Z1a1b | G7521A! G8251A | KC985156 | FJ493513 | ||||||||||||||||||||
| Z1a2 | A11590G | HM044854 | |||||||||||||||||||||
| Z1a2a | A11078G | AY195761 | FJ493515 | ||||||||||||||||||||
| Z1a3 | A11252G | KC985155 | FJ493509 | ||||||||||||||||||||
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| Z3a1 | G15326A | EU597518 | |||||||||||||||||||||
| Z3a1a | A8931G T11075C | JF824889 | FJ383642 | ||||||||||||||||||||
| Z3a2 | T6378C G11902A T12477C G14476A G15884A | FJ383603 | FJ383602 | ||||||||||||||||||||
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| Z4a1a1 | A3520G T7270C T8654C A11719G C16193d C16294T | AP013181 | AP008305 | ||||||||||||||||||||
| Z7 | T2352C C2780T T4363C G4841A C7471d A8348G T8598C G10653A | FJ383629 | FJ383625 | ||||||||||||||||||||
| Z5 | G255A A814G G2056A C4712T G8251A G9053A C14052T G15553A | AP008553 | |||||||||||||||||||||