PhyloTree.org - mtDNA tree Build 17 (18 Feb 2016): subtree M7
Citation: van Oven M, Kayser M. 2009. Updated comprehensive phylogenetic tree of global human mitochondrial DNA variation. Hum Mutat 30(2):E386-E394.
Nucleotide position numbers are consistent with both the rCRS and the RSRS reference sequences.
Mutations are given in forward evolutionary time direction in the format [ancestral base][position number][derived base], e.g. "G15043A".
In case of a transversion, the derived allele is shown in lowercase instead of uppercase, e.g. "C5178a".
Insertions are indicated by the position number preceding the insertion followed by a dot (.), the relative insert position, and the inserted base(s), e.g. "2156.1A".
Deletions are indicated by the letter "d" following the (range of) position number(s) involved, e.g. "A249d" or "8281-8289d".
Mutations that are reversions to an ancestral state (back mutations) are indicated with an exclamation mark (!), two exclamation marks for a double back mutation (!!), etc., e.g. "A15301G!".
Coding-region mutations (np 577-16023) are shown in black; control-region mutations (np 16024-576) in blue.
Mutations between brackets () are recurrent/unstable within the respective clade, or are yet uncertain based on current data.
Mutation motifs in italic are preliminary and are likely to be further refined as additional sequences become available.
The mutations 309.1C(C), 315.1C, AC indels at 515-522, A16182c, A16183c, 16193.1C(C) and C16519T/T16519C were not considered for phylogenetic reconstruction and are therefore excluded from the tree.
Accession numbers provided at the tips of branches are representative examples of mtDNA sequences available at GenBank or from individuals included in HapMap/1000Genomes.
It may be convenient to use the Find function (Ctrl+F) of your browser to search for a particular mutation or haplogroup.
                                        Example accessions
 mt-MRCA (RSRS)                                    
                                       
L1'2'3'4'5'6  C146T  C182T  T4312C  T10664C  C10915T  A11914G  G13276A  G16230A                         
                                     
  L2'3'4'5'6  C152T  A2758G  C2885T  G7146A  T8468C                             
                                     
    L2'3'4'6  C195T  A247G  A825t  T8655C  A10688G  C10810T  G13105A  T13506C  G15301A  A16129G  T16187C  C16189T               
                                     
      L3'4'6  G4104A  A7521G                             
                                     
        L3'4  T182C!  T3594C  T7256C  T13650C  T16278C                       
                                     
          L3  A769G  A1018G  C16311T                       
                                     
            N  G8701A  C9540T  G10398A  C10873T  A15301G!                 
                                     
              R  T12705C  T16223C                     
                                     
                R0  G73A  A11719G                   
                                     
                  HV  T14766C                   
                                     
                    H  G2706A  T7028C               
                                     
                      H2  G1438A               
                                     
                        H2a  G4769A             
                                     
                          H2a2  G750A           
                                     
                            H2a2a  G8860A  G15326A       
                                     
                              H2a2a1  G263A        rCRS
                                     
            M  T489C  C10400T  T14783C  G15043A                   
                                     
              M7  C6455T  T9824C                     
                                     
                M7a  T2626C  C2772T  T4386C  A4958G  G12771A  T16209C             
                                     
                     T16324C                    AP008394
                                       
                    M7a1  5899.XC  G14364A                AP008600
                                     
                      M7a1a  T11017C  A11084G              AP010717 AP008402
                                     
                        M7a1a1  T11722C              AP009451 AP008548
                                     
                          M7a1a1a  A9299G            AP008249 AP010747
                                     
                        M7a1a2  G207A  G1442A  A15218G  T16189C!        AP008507 AP008731
                                     
                        M7a1a3  A11167G  T11701C            AP008585 AP008372
                                     
                        M7a1a4  T4047C  A14185t            AP008367
                                     
                          M7a1a4a  T11368C  A14148G  C15886T        AP008699 AP008503
                                     
                        M7a1a5  T13768C              AP008280
                                     
                          M7a1a5a  G7852A            AP013259 AP008728
                                     
                        M7a1a6  A3756G              AP009423
                                     
                          M7a1a6a  T152C!  T16223C          AP008483 AP013205
                                     
                        M7a1a7  C16291T              AP010750 AP008734
                                     
                        M7a1a8  T13500C  A16233G            AP013266 NA18965
                                     
                        M7a1a9  G4048A              AP008466 NA19001
                                     
                      M7a1b  G6018A  A7403G  C13110T           
                                     
                        M7a1b1  T204C  G207A  T408a  T1977C          AP008266 JX987459
                                     
                        M7a1b2  T152C!  G3316A  A7784G  A13032G  C13788T  A15844G      AP009443 AP013148
                                     
                  M7a2  A15422G                    AP010826
                                     
                    M7a2a  T146C!  T16140C                AP013134
                                     
                      M7a2a1  T8176C  A12234G  T16093C            AP010824 AP008689
                                     
                      M7a2a2  T961C  965.XC  T8005C            AP010825 AP010763
                                     
                      M7a2a3  G1888A  A4093G  T10966C  C16187T!          EF153781
                                     
                        M7a2a3a  T15449C              KF148516 KF148524
                                     
                M7b'c  C4071T                     
                                     
                  M7b  C12405T                   
                                     
                    M7b1  A5351G  G5460A  T7684C  G7853A  G16129A!           
                                     
                      M7b1a  T199C  G4048A  A4164G  T6680C  T16297C         
                                     
                        M7b1a1  C150T  T12811C            KC569547 KC505115
                                     
                          M7b1a1a  T16189C!            NA18636
                                     
                            M7b1a1a1  T10345C  T16298C        AP008365 AY255173
                                     
                              M7b1a1a1a  G8020A        AP008902 AP008354
                                     
                              M7b1a1a1b  G4113A        AP008621 AP008429
                                     
                                M7b1a1a1b1  G7269A      NA18952 AP013274
                                     
                              M7b1a1a1c  T195a        AP008485 AP008625
                                     
                              M7b1a1a1d  T7961C        AP013226 AP010979
                                     
                            M7b1a1a2  T1694C  C11659T        JF896798 NA18769
                                     
                            M7b1a1a3  T204C  (C456T)  A14978G        NA18943 HG00512
                                     
                          M7b1a1b  T204C  G3483A  A16129G!!        AY255159 JX987469
                                     
                             (C16192T)          EF153820 AP012426
                                       
                            M7b1a1c  T159C  C10159T  T11944C  T16092C      FJ198219 NA18550
                                     
                              M7b1a1c1  C182T!!  A16254G      HM357816 FJ198221
                                     
                            M7b1a1d  A6125G          HG00403
                                     
                              M7b1a1d1  T980C        GU123012 HG00593
                                     
                            M7b1a1e  C6228T          GU810069
                                     
                              M7b1a1e1  A10232G        HM357821 JX987463
                                     
                              M7b1a1e2  C11407T  C16527T      HG00448 JX987447
                                     
                            M7b1a1f  T8110C          JQ704806 JX987450
                                     
                            M7b1a1g  G5252A  G7598A        GU392102 NA18644
                                     
                            M7b1a1h  A10397G          AP010993 FJ198220
                                     
                            M7b1a1i  T16126C          KF540506
                                     
                              M7b1a1i1  T146C!  A3995G      JX987442 JX987457
                                     
                        M7b1a2  G1664A  T6351C  A9468G  C10497T  T12121C  C14115T  T16086C  T16223C  NA17969
                                     
                          M7b1a2a  T16324C            KF849908 DQ272126
                                     
                            M7b1a2a1  T4454C          KF540759 KF540571
                                     
                              M7b1a2a1a  G709A  T7175C  C15912T    KF540556 KF540953
                                     
                              M7b1a2a1b  T13965C        KF540574
                                     
                                M7b1a2a1b1  T471C      KF540567 KF540598
                                     
                      M7b1b  C958T  A12358G  A14053G  A14314G  T16152C  C16179T  C16192T  T16362C    HM030531 EF153817
                                     
                    M7b2  A723G  A3140G  C5324T  G8027A  C14284T  C16184T          HM030527
                                     
                      M7b2a  T16086C  A16235G              HM030506 JX987443
                                     
                  M7c  T146C!  C4850T  C11665T  T12091C             
                                     
                    M7c1  T199C  T5442C  (C16295T)             
                                     
                      M7c1a  G3882A                HQ157976
                                     
                        M7c1a1  G12372A  G13759A           
                                     
                          M7c1a1a  A12810G            KF849978
                                     
                            M7c1a1a1  G9266A          HM036561 EU007890
                                     
                          M7c1a1b  C146T!!  G3736A  G10586A  T16304C        HM852807
                                     
                            M7c1a1b1  A15769G  G16145A        KF148264 KF148418
                                     
                        M7c1a2  C16294T              HM030547
                                     
                          M7c1a2a  C6053T  T12804C  A14755t        EU597541
                                     
                            M7c1a2a1  T7961C          EF153823 AP010681
                                     
                        M7c1a3  G16319A              JX987458
                                     
                          M7c1a3a  G513A            NA18618 AP008647
                                     
                        M7c1a4  C12906a             
                                     
                          M7c1a4a  T9797C  C11815a  T16362C        KF849961 NA18756
                                     
                          M7c1a4b  T334C  A5894G          KF541008 KC251746
                                     
                        M7c1a5  A373G  T4452C  A7960G  C11389T  T15787C  A15924G      AP008755 EF397561
                                     
                      M7c1b  G12561A                AY255158
                                     
                        M7c1b1  G15884A              EF153782 EF153790
                                     
                        M7c1b2  T9957C  G13590A           
                                     
                          M7c1b2a  T16172C            NA18639 EF153818
                                     
                          M7c1b2b  G7337A  T10861C          JX987455 NA18152
                                     
                      M7c1c  A3606G  A15236G              JQ702664
                                     
                        M7c1c1  G13204A  T16249C  G16319A          KF540546
                                     
                          M7c1c1a  C16242T            KF540664
                                     
                            M7c1c1a1  C12049T          KC994065 HM238203
                                     
                        M7c1c2  C146a  T16223C            JX987460 JX987445
                                     
                          M7c1c2a  C16147T            JX987468 DQ272117
                                     
                        M7c1c3  T16362C              JX987452 HM596650
                                     
                          M7c1c3a  T5775C  C16168T          GU733792
                                     
                            M7c1c3a1  T2887C  A11893G        JX987466 HM238218
                                     
                          M7c1c3b  C630T            HM596659 JX987453
                                     
                          M7c1c3c  G6260A  T6681C  A11908G  A13563G        NA18674 JX987462
                                     
                          M7c1c3d  G3915A  G7853A  T13768C        JQ703844 GU733735
                                     
                          M7c1c3e  T16086C            AP012360 AP012363
                                     
                          M7c1c3f  T8023C  T16392C          KC994090 KC994116
                                     
                          M7c1c3g  G8856A            KC994102 KC994012
                                     
                          M7c1c3h  T16324C            KC994106 KC994099
                                     
                          M7c1c3i  455.1T            KC994051 KC994126
                                     
                    M7c2  A3912G  A5378G  C9449T  C10897T  C11932T  A14053G  C15338T  T16172C  T16311C!      HQ157984
                                     
                      M7c2a  C16291T                HM030509 JX987470
                                     
                      M7c2b  A11084G                KF540705 EF153810
                                     
                    M7c3  T4856C  G5460A  C11527T  T11875C  A12950G  A14118G          KF540540 HM030532