| PhyloTree.org - mtDNA tree Build 17 (18 Feb 2016): subtree G | |||||||||||||||||||||
| Citation: van Oven M, Kayser M. 2009. Updated comprehensive phylogenetic tree of global human mitochondrial DNA variation. Hum Mutat 30(2):E386-E394. | |||||||||||||||||||||
| Nucleotide position numbers are consistent with both the rCRS and the RSRS reference sequences. | |||||||||||||||||||||
| Mutations are given in forward evolutionary time direction in the format [ancestral base][position number][derived base], e.g. "G15043A". | |||||||||||||||||||||
| In case of a transversion, the derived allele is shown in lowercase instead of uppercase, e.g. "C5178a". | |||||||||||||||||||||
| Insertions are indicated by the position number preceding the insertion followed by a dot (.), the relative insert position, and the inserted base(s), e.g. "2156.1A". | |||||||||||||||||||||
| Deletions are indicated by the letter "d" following the (range of) position number(s) involved, e.g. "A249d" or "8281-8289d". | |||||||||||||||||||||
| Mutations that are reversions to an ancestral state (back mutations) are indicated with an exclamation mark (!), two exclamation marks for a double back mutation (!!), etc., e.g. "A15301G!". | |||||||||||||||||||||
| Coding-region mutations (np 577-16023) are shown in black; control-region mutations (np 16024-576) in blue. | |||||||||||||||||||||
| Mutations between brackets () are recurrent/unstable within the respective clade, or are yet uncertain based on current data. | |||||||||||||||||||||
| Mutation motifs in italic are preliminary and are likely to be further refined as additional sequences become available. | |||||||||||||||||||||
| The mutations 309.1C(C), 315.1C, AC indels at 515-522, A16182c, A16183c, 16193.1C(C) and C16519T/T16519C were not considered for phylogenetic reconstruction and are therefore excluded from the tree. | |||||||||||||||||||||
| Accession numbers provided at the tips of branches are representative examples of mtDNA sequences available at GenBank or from individuals included in HapMap/1000Genomes. | |||||||||||||||||||||
| It may be convenient to use the Find function (Ctrl+F) of your browser to search for a particular mutation or haplogroup. | |||||||||||||||||||||
| Example accessions | |||||||||||||||||||||
| mt-MRCA (RSRS) | |||||||||||||||||||||
| L1'2'3'4'5'6 | C146T C182T T4312C T10664C C10915T A11914G G13276A G16230A | ||||||||||||||||||||
| L2'3'4'5'6 | C152T A2758G C2885T G7146A T8468C | ||||||||||||||||||||
| L2'3'4'6 | C195T A247G A825t T8655C A10688G C10810T G13105A T13506C G15301A A16129G T16187C C16189T | ||||||||||||||||||||
| L3'4'6 | G4104A A7521G | ||||||||||||||||||||
| L3'4 | T182C! T3594C T7256C T13650C T16278C | ||||||||||||||||||||
| L3 | A769G A1018G C16311T | ||||||||||||||||||||
| N | G8701A C9540T G10398A C10873T A15301G! | ||||||||||||||||||||
| R | T12705C T16223C | ||||||||||||||||||||
| R0 | G73A A11719G | ||||||||||||||||||||
| HV | T14766C | ||||||||||||||||||||
| H | G2706A T7028C | ||||||||||||||||||||
| H2 | G1438A | ||||||||||||||||||||
| H2a | G4769A | ||||||||||||||||||||
| H2a2 | G750A | ||||||||||||||||||||
| H2a2a | G8860A G15326A | ||||||||||||||||||||
| H2a2a1 | G263A | rCRS | |||||||||||||||||||
| M | T489C C10400T T14783C G15043A | ||||||||||||||||||||
| M12'G | G14569A | ||||||||||||||||||||
| G | G709A A4833G T5108C T16362C | ||||||||||||||||||||
| G1 | T8200C G15323A G15497A | NA18634 | |||||||||||||||||||
| G1a | C150T C7867T | ||||||||||||||||||||
| G1a1 | A15860G T16325C | HM460792 | NA18163 | ||||||||||||||||||
| G1a1a | A4793G G11914A! | AP008511 | AP010753 | ||||||||||||||||||
| G1a1a1 | A827G | AP008696 | AP009447 | ||||||||||||||||||
| G1a1a2 | A1299G | AP013178 | AP011057 | ||||||||||||||||||
| G1a1a3 | C5263T A8566G C16187T! | AP008909 | AP008809 | ||||||||||||||||||
| G1a1a4 | T6167g | AP008845 | AP011049 | ||||||||||||||||||
| G1a1b | C12178T | EF153773 | KF540834 | ||||||||||||||||||
| G1a2'3 | C16184T | ||||||||||||||||||||
| G1a2 | A12040G C16290T | DQ272114 | NA18764 | ||||||||||||||||||
| G1a3 | T150C! G4833A! C16214T | AP013126 | AP008618 | ||||||||||||||||||
| G1b | (G207A) A12361G A12972G T16017C (T16093C) C16362T! | ||||||||||||||||||||
| G1b1 | A16207G | KF148338 | EF153826 | ||||||||||||||||||
| G16129A! | KF148158 | KF148075 | |||||||||||||||||||
| G1b2 | T4646C G10143A | EF153829 | EU007841 | ||||||||||||||||||
| G1b3 | T16172C A16265G | KF148165 | EF153805 | ||||||||||||||||||
| G1b4 | T3456C | KF148577 | KF148275 | ||||||||||||||||||
| G1c | T593C G9966A | AP012400 | EF153821 | ||||||||||||||||||
| G1c1 | T2226C T15565C A16220G | AY255137 | FJ748707 | ||||||||||||||||||
| G1c2 | T4973C C8161T | NA18570 | FJ198218 | ||||||||||||||||||
| G2 | C5601T A13563G | ||||||||||||||||||||
| G2a'c | G9575A | ||||||||||||||||||||
| G2a | G7600A A9377G (A16227G) C16278T! | ||||||||||||||||||||
| G2a1 | T14200C | FJ198217 | |||||||||||||||||||
| G2a1b | T146C! G207A T8063C G9266A A12753G A15758G | AP008535 | AP008448 | ||||||||||||||||||
| T16189C! | AP008515 | AY255157 | |||||||||||||||||||
| A16194G | AP008569 | ||||||||||||||||||||
| G2a1c | T16195C | AP011017 | AP008452 | ||||||||||||||||||
| G2a1c1 | G16194c | AP008401 | AP008294 | ||||||||||||||||||
| G2a1c2 | G7337A | AP008662 | AP010768 | ||||||||||||||||||
| G2a1d | G260A A6737G T12311C | ||||||||||||||||||||
| G2a1d1 | C4505T C14281T | AP008427 | AP008668 | ||||||||||||||||||
| G2a1d1a | T9165C | AP008313 | NA19003 | ||||||||||||||||||
| G2a1d2 | G4833A! C8748T C16189T!! | KF849931 | |||||||||||||||||||
| G2a1d2a | A8108G A8440G | HM030544 | NA18526 | ||||||||||||||||||
| G2a1e | A16051G C16150T | AP008528 | AP010772 | ||||||||||||||||||
| G2a1f | C16114T | NA18635 | |||||||||||||||||||
| G2a1f1 | T199C C4843T T10248C | KF849943 | JF824853 | ||||||||||||||||||
| G2a1g | T318C A16293c | KF849910 | HM460794 | ||||||||||||||||||
| G2a1h | T3777C G13194A T16311C! | HM036563 | FJ383503 | ||||||||||||||||||
| T152C! | EU545470 | ||||||||||||||||||||
| G2a2 | T711C C8943T G15110A | JF824917 | |||||||||||||||||||
| G2a2a | G207A A13395G | JQ705820 | JX266266 | ||||||||||||||||||
| G2a3 | G185A G3882A C16262T C16294T | KC911517 | |||||||||||||||||||
| G2a3a | C16169T A16318G G16526A | GU123045 | EU523127 | ||||||||||||||||||
| G2a4 | A12280G A16272G G16319A | JF824986 | JX266262 | ||||||||||||||||||
| G2a5 | T4688C G12192A C13383T G14861A A15562G C16234T | AP008897 | AP008301 | ||||||||||||||||||
| G2c | T152C! T195C! T5782C C7503d T12441C G13145A A14839G | JF824842 | KF849950 | ||||||||||||||||||
| G2b | T8877C | ||||||||||||||||||||
| G2b1 | G4853A | ||||||||||||||||||||
| G2b1a | C11151T | FJ015040 | KF849921 | ||||||||||||||||||
| G2b1a1 | G207A T3398C G4048A T13191C T14182C | JX289093 | JX289114 | ||||||||||||||||||
| G2b1a2 | G263A T3593C T16172C | KF849956 | AY255139 | ||||||||||||||||||
| G2b1b | T12375C A16269G | FJ383505 | FJ748756 | ||||||||||||||||||
| G2b2 | A6932G | EU597571 | |||||||||||||||||||
| G2b2a | A1692G C4680a | FJ383509 | FJ383510 | ||||||||||||||||||
| G2b2b | G15930A C16260T | HQ260973 | AP010829 | ||||||||||||||||||
| G2b2c | G3591A A16183G | GU123035 | JF824915 | ||||||||||||||||||
| G3 | G16274A | ||||||||||||||||||||
| G3a | A15746G | ||||||||||||||||||||
| G3a1'2 | G143A | ||||||||||||||||||||
| G3a1 | A16t C150T G11914A! A16215G C16362T! | GU014566 | |||||||||||||||||||
| G3a1a | C8861T | DQ272108 | GU014569 | ||||||||||||||||||
| G3a2 | T7621C | KF540726 | |||||||||||||||||||
| T152C! | JN580300 | ||||||||||||||||||||
| G3a2a | 573.XC T6086C T6221C T16189C! A16265c | AP008645 | DQ272111 | ||||||||||||||||||
| G3a3 | T12408C G16390A | KF849958 | GU392096 | ||||||||||||||||||
| G3b | G13477A A14605G G15927A | ||||||||||||||||||||
| G3b1 | T195C! C9599T | FJ748726 | AF346966 | ||||||||||||||||||
| G3b2 | T6896C | DQ272109 | KF849979 | ||||||||||||||||||
| G4 | 191.1A C194T A5051G G5460A T6216C G7521A! T7660C A9670G T11383C T15940C (T16093C) C16114a | AP008911 | AP013144 | ||||||||||||||||||