PhyloTree.org - mtDNA tree Build 17 (18 Feb 2016): subtree B
Citation: van Oven M, Kayser M. 2009. Updated comprehensive phylogenetic tree of global human mitochondrial DNA variation. Hum Mutat 30(2):E386-E394.
Nucleotide position numbers are consistent with both the rCRS and the RSRS reference sequences.
Mutations are given in forward evolutionary time direction in the format [ancestral base][position number][derived base], e.g. "G15043A".
In case of a transversion, the derived allele is shown in lowercase instead of uppercase, e.g. "C5178a".
Insertions are indicated by the position number preceding the insertion followed by a dot (.), the relative insert position, and the inserted base(s), e.g. "2156.1A".
Deletions are indicated by the letter "d" following the (range of) position number(s) involved, e.g. "A249d" or "8281-8289d".
Mutations that are reversions to an ancestral state (back mutations) are indicated with an exclamation mark (!), two exclamation marks for a double back mutation (!!), etc., e.g. "A15301G!".
Coding-region mutations (np 577-16023) are shown in black; control-region mutations (np 16024-576) in blue.
Mutations between brackets () are recurrent/unstable within the respective clade, or are yet uncertain based on current data.
Mutation motifs in italic are preliminary and are likely to be further refined as additional sequences become available.
The mutations 309.1C(C), 315.1C, AC indels at 515-522, A16182c, A16183c, 16193.1C(C) and C16519T/T16519C were not considered for phylogenetic reconstruction and are therefore excluded from the tree.
Accession numbers provided at the tips of branches are representative examples of mtDNA sequences available at GenBank or from individuals included in HapMap/1000Genomes.
It may be convenient to use the Find function (Ctrl+F) of your browser to search for a particular mutation or haplogroup.
                                                  Example accessions
 mt-MRCA (RSRS)                                              
                                                 
L1'2'3'4'5'6  C146T  C182T  T4312C  T10664C  C10915T  A11914G  G13276A  G16230A                                   
                                               
  L2'3'4'5'6  C152T  A2758G  C2885T  G7146A  T8468C                                       
                                               
    L2'3'4'6  C195T  A247G  A825t  T8655C  A10688G  C10810T  G13105A  T13506C  G15301A  A16129G  T16187C  C16189T                         
                                               
      L3'4'6  G4104A  A7521G                                       
                                               
        L3'4  T182C!  T3594C  T7256C  T13650C  T16278C                                 
                                               
          L3  A769G  A1018G  C16311T                                 
                                               
            N  G8701A  C9540T  G10398A  C10873T  A15301G!                           
                                               
              R  T12705C  T16223C                               
                                               
                R0  G73A  A11719G                             
                                               
                  HV  T14766C                             
                                               
                    H  G2706A  T7028C                         
                                               
                      H2  G1438A                         
                                               
                        H2a  G4769A                       
                                               
                          H2a2  G750A                     
                                               
                            H2a2a  G8860A  G15326A                 
                                               
                              H2a2a1  G263A                  rCRS
                                               
                   T16189C!                               
                                                 
                  R11'B6  A12950G                             
                                               
                    B6  C150T  8281-8289d  G9452A  G13928c                     
                                               
                      B6a  A5894c  G11914A!  G14305A  T16093C                    AY255136
                                               
                        B6a1  T150C!  356.1C  A4093G  A16051G                    GQ119045
                                               
                          B6a1a  G1719A  C16093T!  C16527T                  JX289129 AP012415
                                               
                  B4'5  8281-8289d                            KC417443 HM030512
                                               
                    B4  T16217C                           
                                               
                         C16261T                         
                                                 
                        B4a  T5465C  G9123A                      NA17990
                                               
                          B4a1  T10238C                     
                                               
                            B4a1a  T146C!  T6719C  C12239T  A15746G              DQ372871 HM238202
                                               
                              B4a1a1  A14022G  (A16247G)                HQ873527 KJ154569
                                               
                                B4a1a1a  A6905G                HQ873525 KJ154187
                                               
                                  B4a1a1a1  A13479G              JX900618 JX900565
                                               
                                    B4a1a1a1a  A373G            JX900769
                                               
                                      B4a1a1a1a1  A8842G          JX900376 JX900472
                                               
                                    B4a1a1a1b  G7598A            JX900604 JX900773
                                               
                                    B4a1a1a1c  G94A  T10084C          KJ154487 KJ154627
                                               
                                    B4a1a1a1d  T152C!  G12940A          KJ154414 KJ154286
                                               
                                  B4a1a1a2  C16292T              JX900433 HQ873516
                                               
                                    B4a1a1a2a  T15905C            JX900535 JX900548
                                               
                                    B4a1a1a2b  T16136C            KJ154620 KJ154535
                                               
                                  B4a1a1a3  T14470C              JX900766 JX900480
                                               
                                  B4a1a1a4  T16249C              JX900408 HQ873490
                                               
                                  B4a1a1a5  G14560A  G15355A            JX900578 JX900762
                                               
                                  B4a1a1a6  T10931C              JX900564 JX900841
                                               
                                  B4a1a1a7  T14540C  (T16093C)            JX900343 JX900331
                                               
                                  B4a1a1a8  A235G  G6261A  T12468C          JX900752 KJ154435
                                               
                                  B4a1a1a9  G2706A  A16163G            JX900826 JX900819
                                               
                                  B4a1a1a10  G10364A              JX900412 JX900614
                                               
                                  B4a1a1a11  C13943T              JX900639
                                               
                                    B4a1a1a11a  T10966C            HQ873524 JX900497
                                               
                                    B4a1a1a11b  T16261C!            JX900344 KJ154230
                                               
                                  B4a1a1a12  A16305G              JX900373 JX900802
                                               
                                  B4a1a1a13  A4093G              JX900500 AY289093
                                               
                                  B4a1a1a14  G16390A              KJ154580 KJ154589
                                               
                                  B4a1a1a15  G13759A              KJ154242 KJ154315
                                               
                                  B4a1a1a16  A16182t              JX900734 KJ154328
                                               
                                  B4a1a1a17  C7534T              KJ154515 KJ154591
                                               
                                  B4a1a1a18  G9145A  A16051G            KJ154415 KJ154356
                                               
                                  B4a1a1a19  A16302G              KJ154865 HQ873515
                                               
                                  B4a1a1a20  G11016A  G16274A            KJ154207 KJ154294
                                               
                                  B4a1a1a21  T4216C              JX900558 KJ154218
                                               
                                  B4a1a1a22  T3398C              KJ154215 KJ154210
                                               
                                     T195C!              JX900455 JX900848
                                                 
                                    B4a1a1a23  A9734G            JX900644 KJ154480
                                               
                                B4a1a1b  C1473T  T3423a              FJ767912 FJ767910
                                               
                                B4a1a1c  C1185T  G4769A              KJ154275 KJ154368
                                               
                                B4a1a1d  A6581G                JX900453 HQ873507
                                               
                                B4a1a1e  G3391A                JX900634 JX900555
                                               
                                B4a1a1f  A7740G                JX900410 JX900411
                                               
                                B4a1a1g  A8338G                JX900722 JX900543
                                               
                                B4a1a1h  T318C  T10031C              JX900348 JX900338
                                               
                                B4a1a1i  T11399C  G11887A              JX900622 JX900779
                                               
                                B4a1a1j  A16289t                JX900692 JX900794
                                               
                                B4a1a1k  A16399G                KJ154396 KJ154220
                                               
                                  B4a1a1k1  G70A  T16352C            KJ154221 KJ154190
                                               
                                   C151T                KJ154269 KJ154287
                                                 
                                  B4a1a1m  T2416C              KJ154397 KJ154364
                                               
                                    B4a1a1m1  A1692G            AY289068 KJ154402
                                               
                                B4a1a1n  G8572A                JX900810 KJ154312
                                               
                                   T152C!                HQ873531 AF347007
                                                 
                                  B4a1a1o  C11203T              JX900738 JX900828
                                               
                                B4a1a1p  A13416G                JX900384 JX900387
                                               
                                B4a1a1q  G16255A                HQ873532 JX900508
                                               
                                   T16126C                KJ154410 KJ154226
                                                 
                                  B4a1a1r  C3909T             
                                               
                                B4a1a1s  C11407T                KJ154474 KJ154645
                                               
                                B4a1a1t  G15221A                KJ154214 KJ154367
                                               
                                B4a1a1u  G10325A                KJ154439 KJ154259
                                               
                                B4a1a1v  A7346G  C13908T              KJ154288 KJ154257
                                               
                                B4a1a1w  T7389C                KJ154872 KJ154864
                                               
                                B4a1a1x  A15924G                KJ154158 DQ372877
                                               
                                B4a1a1y  T15601C                JX900630 JX900846
                                               
                                B4a1a1z  A14683G                KJ154929 KJ154925
                                               
                                B4a1a1aa  T4742C  T16311C!              AY963574 KJ154629
                                               
                                B4a1a1ab  A9809G                JX900575 KJ154209
                                               
                                B4a1a1ac  G8790A                JX900514 KJ154307
                                               
                                B4a1a1ad  G5460A  A15061G              KJ154208 KJ154233
                                               
                                B4a1a1ae  T7058C                HQ873511 HQ873509
                                               
                                B4a1a1af  A16212G                KJ154891 KJ154884
                                               
                              B4a1a2  T4733C  G6366A  T12519C              AJ842748 AJ842745
                                               
                              B4a1a3  A14449G                  HQ873558
                                               
                                B4a1a3a  C16223T!                HQ873560
                                               
                                  B4a1a3a1  A8525G              HQ873543 KC994063
                                               
                                    B4a1a3a1a  T195C!  T14290C          AJ842744 KF540509
                                               
                              B4a1a4  C4025T  G4769A                KC994073 AJ842747
                                               
                              B4a1a5  G4048A                  GQ119021 HQ873542
                                               
                                B4a1a5a  (C146T!!)  A5539G              KC994105 KC994064
                                               
                              B4a1a6  A11928G                  KC994047 KC994101
                                               
                                B4a1a6a  G3483A                KC994027 KC994097
                                               
                              B4a1a7  C6492T  A13350G                HQ873557 KF540551
                                               
                               T16311C!                    EU597506
                                                 
                              B4a1b  G9932A  T10915C!  T13143C  T16288C            AP008595
                                               
                                B4a1b1  C16268T                AP008842
                                               
                                  B4a1b1a  T9977C              AP008640 AF346993
                                               
                              B4a1e  T3548C  C16168T                JN866824 KF849945
                                               
                            B4a1c  G709A                   
                                               
                              B4a1c1  A9254G                  AP008650
                                               
                                B4a1c1a  C15292T                AP013242 JF824900
                                               
                                  B4a1c1a1  G73c  T89C              AP008912 NA18975
                                               
                                 T146C!                 
                                                 
                                B4a1c2  A7052G  A7271G  C9822a  C15661T  C16167T  A16317G        AY519495 AY519492
                                               
                                B4a1c4  A12904G                EU597505 HQ873562
                                               
                                B4a1c5  C11632T  C12237T  A15038G            HQ873564 KF540685
                                               
                              B4a1c3  A16194c  T16195C               
                                               
                                B4a1c3a  T310C  C3960T  A4203G  C5263T  C7927T  T15479C  G16000A  C16266g      AP010705 AP008412
                                               
                                B4a1c3b  T4218C  T4907C              AP008521 KF849971
                                               
                            B4a1d  A5894G                    HQ873495 HQ873566
                                               
                          B4a2  T6620C  C9812T                   
                                               
                            B4a2a  T4823C  T16324C                  HQ873538 HM596696
                                               
                              B4a2a1  G5824A  A6131G  G15777A  G16129A!            AJ842751 HM238207
                                               
                              B4a2a2  G3693A  T16154C                HQ873563 KF540572
                                               
                              B4a2a3  T11992C  A12366G  A16272G              AJ842750 KF540774
                                               
                            B4a2b  C16360T                    NA18528
                                               
                              B4a2b1  A10876G                  JF824854 KF849947
                                               
                                B4a2b1a  A9069G  A13413G              AP013280 AP008257
                                               
                          B4a3  G15355A  C15632a  T15940C  T15941C  T15983C  T16092C  A16399G            FJ748745 AP008567
                                               
                          B4a4  A193G  C14751T  A16299G                  AP008384 NA18794
                                               
                          B4a5  T5814C  T12732C  A14518G                  KF540699 KF540665
                                               
                        B4g  C9968T  G16213A  C16292T                   
                                               
                          B4g1  G7789A                      JQ703874
                                               
                            B4g1a  T5108C  G14905A                  GU810060 HQ873489
                                               
                            B4g1b  T11353C  C13547T  G16153A                NA18109 NA18770
                                               
                          B4g2  G62A  C2378T  C6482T  C16301T                  KF540983 HG00419
                                               
                        B4h  T5093C  A13269G  G16129A!                    GU377090
                                               
                          B4h1  T4703C  C16217T!                    KF849963 HQ873569
                                               
                        B4i  A6302G                        JF824906
                                               
                          B4i1  T6497C  G9329A                    KC733274 NA18541
                                               
                        B4k  T5483C  C12741T  T16093C                    KF849913 EU597559
                                               
                        B4m  A10398G!  A16240G                      KF540707 KF540708
                                               
                      B4b'd'e'j  A827G  C15535T                       
                                               
                        B4b  G499A  G4820A  G13590A                   
                                               
                          B2  A3547G  T4977C  C6473T  T9950C  C11177T                EU095548 EF079874
                                               
                            B2a  C16111T  G16483A                  KC711022 KC711021
                                               
                              B2a1  A10895G                  DQ282442 KC711026
                                               
                                B2a1a  T14766C                DQ282444
                                               
                                  B2a1a1  A12729G              JQ702668 KC711024
                                               
                                B2a1b  T3027C  C12890T              DQ282445 KC711025
                                               
                              B2a2  A9097G                  DQ282441 KC711028
                                               
                              B2a3  A551G  G5054A                HQ012136 KC711031
                                               
                              B2a4  T16092C                  JQ703852
                                               
                                B2a4a  G228A                KC711033
                                               
                                  B2a4a1  A3663G  G10685A  T16325C          KC711034 KC711035
                                               
                              B2a5  A189G  C5987T  A11884G  A13221G  C16278T!            AF347001 KC711039
                                               
                            B2b  G6755A                    EU095532
                                               
                                 T152C!                  HG01437 EU095210
                                                 
                                B2b1  G207A  A1041G  A1842G  T4226C  C4814T  T16093C  A16175G      JF431064
                                               
                              B2b2  G16145A                  KC503926
                                               
                                B2b2a  T209C  T3394C  G6260A  T9233C  T10915C!  A11968G  C16320T      KC503927 KC503925
                                               
                              B2b3  G13708A                  EU095221
                                               
                                B2b3a  T152C!  C271T  G3918A  T4232C  T15784C  T16249C  A16312G        HG00640 EU095216
                                               
                              B2b4  (T159C)  (T195C)  A8641G  C9605T  T11569C  G15521A  (C16189T!!)  (C16239T)  (C16353T)    HQ012137 EF657326
                                               
                            B2c  A7241G                    DQ282436
                                               
                              B2c1  T9098C                  DQ282438 DQ282439
                                               
                                B2c1a  G6722A                DQ282434 HQ012177
                                               
                                B2c1b  A4435G  A7262G  A7822G            HQ012160 DQ282437
                                               
                                B2c1c  T14063C                HQ012164 NA19731
                                               
                              B2c2  T146C!  T4755C  T14757C              HQ012143
                                               
                                B2c2a  C8702T  G16319A              HQ012140 HQ012158
                                               
                                B2c2b  T152C!  T9682C  A13661G  C16295T            HQ012151 JQ705349
                                               
                            B2d  C498d  A4122G  A4123G  T8875C  T9682C              EU095550 HG01494
                                               
                            B2e  C6119T  C14049T                  EU597569 EU095209
                                               
                            B2f  A3796G  C3996T  T10535C  A13833G              EU334872 EF657347
                                               
                            B2g  C114g  T3766C  C6164T               
                                               
                              B2g1  C1002T  T16298C                HQ012185 HQ012145
                                               
                              B2g2  G7340A  C11647T  T11875C              KC257372 JQ702661
                                               
                            B2h  A11821G  T16468C                  EU095206 EU095215
                                               
                            B2i  A6272G                   
                                               
                              B2i1  T430C  T485C  T961C  T16311C!              EU095218 EU095217
                                               
                              B2i2  A470G  G11611A  G15077A              JX413035
                                               
                                B2i2a  A16207G                JX413013 JX413012
                                               
                                  B2i2a1  T10248C  C16291T            JX413023 JX413022
                                               
                                    B2i2a1a  C4259T  A12400G          JX413014 JX413019
                                               
                                    B2i2a1b  A3843G            JX413020 JX413021
                                               
                                B2i2b  G207A                JX413027 JX174728
                                               
                                  B2i2b1  A153G  T16249C            JX413032 JX413033
                                               
                            B2j  T131C  A183G  C5270T  A15924G  A16166G  G16361A            JF431059 JF431060
                                               
                            B2k  T146C!  T4371C                  HQ012156 JF431061
                                               
                            B2l  T16422C                    JQ702293 NA19785
                                               
                            B2m  A15766G  A16164G  C16519a                HQ012141 NA19761
                                               
                            B2n  A4191G  G6383A                  HQ012163 NA19795
                                               
                            B2o  T16092C                    JQ703851
                                               
                              B2o1  T7270C  G16145A                KC503933
                                               
                                B2o1a  T152C!  A14500G              KC503931 KC503932
                                               
                            B2p  C2380T  T8222C  G11696A                HQ012138 HQ012167
                                               
                            B2q  T4047C                    HQ012153 HQ012176
                                               
                            B2r  C5899d                    HQ012175 DQ282435
                                               
                            B2s  T310C  T8567C  T12616C  T13740C  T16152C  T16325C            HQ012165 NA19780
                                               
                            B2t  A10792G  A15244G  G15884A  C16259T  T16357C  C16467T            NA19684 JQ705648
                                               
                            B2u  T152C!  C182T!!  A3927G  T5492C  A8146G  C16256T            HQ012183 HQ012170
                                               
                            B2v  C7376T  C15661T  T16140C                HQ012173 HQ012159
                                               
                               C16278T!                    HQ012172
                                                 
                              B2w  T146C!  A11950G  G14569A  C16270g            JQ705755 HQ012168
                                               
                            B2x  A4129G  G10646A  C11389T  C12346T  T16323C              HQ012147 NA19681
                                               
                            B2y  C16261T                    EU597534
                                               
                              B2y1  A3480G                  JQ705259 EU431084
                                               
                          B4b1  T16136C                     
                                               
                            B4b1a  G6023A  T6413C                  AY519494
                                               
                                 G207A                 
                                                 
                                B4b1a1  T199C  A202G  G2831A  T4117C  G8206A  A15236G  A16284G        AP008325 AP010733
                                               
                                  B4b1a1a  G7664A              AP008848 AP009471
                                               
                                  B4b1a1b  G10685A              AP009444 AP013219
                                               
                                  B4b1a1c  T16357C              AP008900 AP013162
                                               
                                B4b1a2  T6216C                KC993941 AP008856
                                               
                                  B4b1a2a  G1719A  A2220G  5899.XC          AY255170 AP010671
                                               
                                  B4b1a2b  A16300G             
                                               
                                    B4b1a2b1  G9305A            KC994146 GU733790
                                               
                                    B4b1a2b2  A8659G  A13105G!          KF540811 KF540644
                                               
                                  B4b1a2c  C13599T  T16311C!            GU733724 GU733744
                                               
                                  B4b1a2d  C2836T  C14004T  A14053G  C15459T  T16131C        GU733814 GU733825
                                               
                                  B4b1a2e  T1452C  C3648T            JF824980 EU597553
                                               
                                  B4b1a2f  G709A  T14110C            KF540629 KF541024
                                               
                                  B4b1a2g  C16365T              KF540610
                                               
                                    B4b1a2g1  A7843G            KF540608 KF540617
                                               
                                  B4b1a2h  T14783C              KF540519 KF540523
                                               
                                  B4b1a2i  C16067T              KJ154674 KJ154236
                                               
                                B4b1a3  T408a  G9055A  A9338t  T9615C            NA18689 JN857022
                                               
                                  B4b1a3a  T146C!  A14133G  T16086C          KF148375 JN857043
                                               
                            B4b1b'c  C16218T                   
                                               
                              B4b1b  T152C!  T1391C  A3981G  G5585A  C13934T  G14569A  T16298C  T16362C        AP008682 AP008550
                                               
                              B4b1c  A14587G                 
                                               
                                B4b1c1  G7521A!  T9101g  A11239G  G11914A!          HQ873567 AP009450
                                               
                                B4b1c2  A8343G                DQ272119 KF540671
                                               
                        B4d  G11914A!  A13942G                     
                                               
                          B4d1'2'3  G15930A                     
                                               
                            B4d1  A15038G                    AY255135 GU392048
                                               
                              B4d1a  T12732C                  NA18117 JN857029
                                               
                            B4d2  G6722A  A8379G  C8855T  T9701C  T15512C              AY255140
                                               
                            B4d3  C151T  A197G  A546G  A9120G  C12135T  C16185T  (C16193d)  C16234T          NA18619
                                               
                              B4d3a  T5418C                  JF824975
                                               
                                B4d3a1  A5084G                AP010836 AP013142
                                               
                          B4d4  A6040G  C6836T  C9212T  A11314G  A14053G  A14687G  T15470C  A16155G  C16278T!        AP008492 AP013230
                                               
                        B4e  T146C!  G185A  A189G  T195C!  G513A  G6026A  T6614C  G9921A  A10750G            KC733253 AP008436
                                               
                        B4j  T3548C  T4080C  C5300T  C6122T  A11893G  A11941G  A13911G  C14248T  G15172A  C16223T!  T16362C        JN857017
                                               
                      B4c  T1119C  G15346A                       
                                               
                        B4c1  C3497T                       
                                               
                          B4c1a'b  G709A                     
                                               
                            B4c1a  G10310A                    KC521454
                                               
                              B4c1a1  A14133G  T16311C!                NA18982 AP008603
                                               
                                B4c1a1a  T16086C                AP008482 AP008540
                                               
                                  B4c1a1a1  C8844T              AP008298
                                               
                                    B4c1a1a1a  A5592G  G16129A!          AP011003 AP008604
                                               
                                  B4c1a1a2  C6164T              AP008688
                                               
                                B4c1a1b  A6416G                AP008281 AP010696
                                               
                                B4c1a1c  T152C!  T7319C  A14452G            AP010704 NA19088
                                               
                              B4c1a2  C16527T                  JN857019
                                               
                                B4c1a2a  A12373G  T16092C              JN857031 JN857046
                                               
                            B4c1b  C150T  T16140C  G16274A                AP008570
                                               
                              B4c1b1  A211G  455.1T  A3221G  T4742C  T5826C  C7909T  T13879C  G14162A  C16111T  T16154C  A16497G  AP008899
                                               
                                B4c1b1a  T8167a  G15148A  C15391T            AP008920 AP008393
                                               
                                 A16335G                  AP008472
                                                 
                                B4c1b2  C3571T               
                                               
                                  B4c1b2a  T146C!  T8772C            AY255149
                                               
                                    B4c1b2a1  G1709A  T1716C          GQ161177 EF429139
                                               
                                    B4c1b2a2  T195C!  G15301A!!          HM596646
                                               
                                      B4c1b2a2a  T4937C          KC994085 HM238214
                                               
                                      B4c1b2a2b  G7598A          KC994083 HM238200
                                               
                                  B4c1b2b  T195C!  T8200C            NA18156 KF540737
                                               
                                  B4c1b2c  C3435T  T9128C  G11440A          NA18111
                                               
                                    B4c1b2c1  G9575A  T10493C  T16136C  T16249C  C16291T      NA18778 AP013284
                                               
                                    B4c1b2c2  G16129A!  A16166G          KF540661 KF849975
                                               
                          B4c1c  C150T  T195C!  A5441G  A10398G!  A13629G  T15941C              AP009461
                                               
                               T16311C!                    AP009436
                                                 
                              B4c1c1  A214G                  AP008425 AP008450
                                               
                        B4c2  T5108C  T14088C  A14209G  C16147T  C16184a  A16235G                GU810059 AY289101
                                               
                          B4c2a  T9103C                      AF347011 AY289100
                                               
                          B4c2b  T6221C                      GU592219 AP012407
                                               
                          B4c2c  T8823C  G9053A                    GU592216 GU592217
                                               
                      B4f  A200G  573.XC  G1442A  T4612C  A5127G  A6332G  T7389C  G11969A  A13105G!  C16168T  T16172C  T16249C  T16325C  G16390A      JQ703514 AP008788
                                               
                        B4f1  A257G  A8291G  A16523G                    AP013140 AP008262
                                               
                    B5  G709A  G8584A  T9950C  A10398G!  T16140C                     
                                               
                      B5a  A210G  A3537G  A15235G  C16266a                   
                                               
                        B5a1  C6960T                       
                                               
                          B5a1a  G13145A  A13395G                    EU597566 GU810057
                                               
                            B5a1a1  C11881T                    AY950286 AY950290
                                               
                          B5a1b  A10754G  C14989T                    AY255145
                                               
                            B5a1b1  G7852A                    KC505067 GQ119031
                                               
                          B5a1c  G10325A                      KF540745
                                               
                            B5a1c1  A10523G                    KF540703
                                               
                              B5a1c1a  T593C  G5237A                JQ731598 JQ731601
                                               
                                B5a1c1a1  C16262T                JF896801 HG00418
                                               
                            B5a1c2  A4562G  T15514C                  KF849949 JQ731600
                                               
                          B5a1d  T152C!  C4086T  T11465C  C16261T                GU810075 HM596698
                                               
                        B5a2  G9962A  C11151T  A16266G                    HG00543
                                               
                          B5a2a  A93G  G11149A  C14149T                 
                                               
                            B5a2a1  A12234G  C16187T!                 
                                               
                              B5a2a1a  C9189T  A13422G  G14861A  C16256T            EF114286 KF849923
                                               
                                 G16129A!                  JQ731602
                                                 
                                B5a2a1b  C14158T                AP008263 AP008451
                                               
                            B5a2a2  T8614C                   
                                               
                              B5a2a2a  (T204C)  A15046G  T16362C             
                                               
                                B5a2a2a1  G8557A  G15301A!!              DQ372869 KF540936
                                               
                                B5a2a2a2  C16245T                KF540943 KF540901
                                               
                              B5a2a2b  C5027T  C8059T               
                                               
                                B5a2a2b1  A4824G                KC994087
                                               
                                  B5a2a2b1a  G9554A              KF540623 KF540613
                                               
                                B5a2a2b2  T16243a                KF540807 KF540825
                                               
                      B5b  G103A  T204C  G1598A  C8829T  A12361G  C15223T  C15508T  A15662G  A15851G  G15927A  T16243C         
                                               
                        B5b1  (960.1C)  A8784G                      AP010771 AP008284
                                               
                          B5b1a  C11146T  T14470C                    JF824930
                                               
                            B5b1a1  A103G!  T195C!  C16278T!  T16324C                AP008827 AP008631
                                               
                            B5b1a2  T199C  G11914A!  G12192A  C16223T!  A16318t  G16319A            AP008273 AP008288
                                               
                              B5b1a2a  A14959G                  AP008518 AP008875
                                               
                          B5b1c  T152C!  A3480G  C3819T  A5836G  A7771G  C8467T  T10274C            KC994070 GQ119020
                                               
                            B5b1c1  A6116G  A14233G                  KC994143
                                               
                              B5b1c1a  C11207T                  KC994058 KC994128
                                               
                        B5b2  T131C  A4895G  T15850C  C16111T  C16234T  A16463G               
                                               
                          B5b2a  A103G!                      AY519489
                                               
                            B5b2a1  G5744A  T11437C  C16291T                AP008546 AP008847
                                               
                            B5b2a2  G207A  A15758G                  AP009425 AP008371
                                               
                              B5b2a2a  A14750G                 
                                               
                                B5b2a2a1  A8894t                AP008910 AP008403
                                               
                                B5b2a2a2  G103A!!  A7542G  G7853A  A10807G  G15758A!  A16399G        KJ154763 GQ119041
                                               
                          B5b2b  T5964C                      KF148463 KF148089
                                               
                             C204T!                      GU377081
                                                 
                            B5b2c  C481T  C4161T  A11101G                KF540720
                                               
                              B5b2c1  C131T!  G2361A  A12451G              AP008465 HG00404
                                               
                        B5b3  A189G  G203A  T2626C  G6962A  G8856A  A10103G               
                                               
                          B5b3a  T199C  G13477A  C16256T                  AP013282 AP008566
                                               
                          B5b3b  A15758G                      AP010761 AP013129
                                               
                        B5b4  T146C!  T4703C  C7170T  G16274A                    KF849981 JN857015
                                               
                        B5b5  T152C!  T195C!  G3834A  G4924A  A14028G  G14410A  G14831A  A16166G            KF540694 NA18704