Minimal reference phylogeny for the human Y chromosome: subtree J-M304
Citation: van Oven M, Van Geystelen A, Kayser M, Decorte R, Larmuseau MH. 2014. Seeing the wood for the trees: a minimal reference phylogeny for the human Y chromosome. Hum Mutat 35(2):187-191.
Full Y-SNP list with marker details
up to main tree                     Haplogroup designation  
J  M304  P209                   J-M304*(xM267,M172)  
  J1  M267  M497                 J-M267*(xF1614,L827)  
       F1614  Y6304               J-F1614  
       L827  Z2215               J-L827*(xZ1828,L620)  
         Z1828               J-Z1828  
         L620               J-L620*(xFGC6064,L136)  
           FGC6064             J-FGC6064  
           L136             J-L136*(xPF7264,P58)  
             PF7264           J-PF7264  
             P58             J-P58*(xS4924,Z1889)  
               S4924         J-S4924  
               Z1889         J-Z1889*(xZ2324)  
                 Z2324       J-Z2324*(xL858)  
                   L858  Z1884   J-L858*(xFGC11,Z640,YSC76)  
                     FGC11   J-FGC11  
                     Z640   J-Z640  
                     YSC76   J-YSC76  
  J2  M172  L228                 J-M172*(xM410,M12)  
    J2a  M410                 J-M410*(xL581,P354)  
         L581  PF5008  PF5050           J-L581  
         P354  PF4610             J-P354*(xZ6049,L26)  
           Z6049             J-Z6049  
           L26               J-L26*(xZ6064,Z2221,PF5116)  
             Z6064           J-Z6064  
             Z2221  Z2220         J-Z2221*(xL24,PF5197)  
               L24           J-L24*(xM158,L25)  
                 M158       J-M158  
                 L25         J-L25*(xZ7700,PF5294,Z438)  
                   Z7700  F3133   J-Z7700  
                   PF5294  PF5401   J-PF5294  
                   Z438     J-Z438  
               PF5197         J-PF5197*(xZ7430,PF5172)  
                 Z7430       J-Z7430  
                 PF5172       J-PF5172  
             PF5116  PF5125         J-PF5116*(xZ6065,L558)  
               Z6065         J-Z6065  
               L558  Z1846  CTS4800     J-L558*(xY5014,M67)  
                 Y5014  S23154     J-Y5014*(xM319)  
                   M319     J-M319  
                 M67         J-M67*(xZ500,Y4036,Z7671)  
                   Z500  PF5132   J-Z500*(xM92)  
                     M92     J-M92  
                   Y4036     J-Y4036*(xL227)  
                     L227  L210   J-L227  
                   Z7671     J-Z7671  
    J2b  M12  M102  L282               J-M12*(xM205,Z575)  
         M205               J-M205  
         Z575  Z1827             J-Z575*(xL283,Z2432)  
           L283             J-L283  
           Z2432             J-Z2432